Examinando por Autor "Arias, César A."

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    A fatal case of disseminated mucormycosis mimicking a malignancy
    (Springer, 2019) Malek, Alexandre; Arias, César A.; Ostrosky-Zeichner, Luis; Pankow, Stephanie; Wanger, Audrey; Barnett, Ben
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    A trilocus sequence typing scheme for hospital epidemiology and subspecies differentiation of an important nosocomial pathogen, Enterococcus faecalis
    (American Society for Microbiology, 2009) Chowdhury, Shahreen A.; Arias, César A.; Nallapareddy, Sreedhar R.; Reyes, Jinnethe; Willems, Rob J. L.; Beral, Valerie
    En este estudio, presentamos un esquema de tipificación de secuencia trilocus (TLST) basado en regiones intragénicas de dos genes antigénicos, ace y salA (que codifican una adhesina de colágeno / laminina y un antígeno asociado a la pared celular, respectivamente), y un gen asociado con antibiótico resistencia, lsa (que codifica un transportador ABC putativo), para la diferenciación de subespecies de Enterococcus faecalis. Cada uno de los alelos se analizó utilizando 50 aislamientos de E. faecalis que representan 42 tipos de secuencias multilocus diversos (ST M; basado en siete genes de mantenimiento) y cuatro grupos de aislados unidos clonalmente (por electroforesis en gel de campo pulsado [PFGE]). Los perfiles alélicos y / o secuencias concatenadas de los tres genes coincidieron con los resultados de la tipificación de secuencias multilocus (MLST) para la tipificación de 49 de los 50 aislamientos; Además de la única excepción, se encontró que dos aislamientos tenían tipos de TLST idénticos pero eran variantes de un solo locus (que se diferenciaban por un solo nucleótido) según MLST y, por lo tanto, también se clasificaron como relacionados clonalmente por MLST. TLST también fue comparable a PFGE para establecer relaciones epidemiológicas a corto plazo, tipificando todos los aislados clasificados como relacionados clonalmente por PFGE con el mismo tipo. A continuación, se aplicó TLST a aislamientos representativos (de cada subtipo de PFGE y año de aislamiento) de una colección de 48 aislamientos hospitalarios y se demostraron las mismas relaciones entre los aislamientos de una cepa del brote que los encontrados por MLST y PFGE. En conclusión, el esquema TLST descrito aquí demostró ser exitoso para investigar la epidemiología a corto plazo en un entorno hospitalario y puede proporcionar una alternativa a MLST para discriminar aislamientos.
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    An adaptive mutation in enterococcus faecium LiaR associated with antimicrobial peptide resistance mimics phosphorylation and stabilizes LiaR in an activated state
    (Elsevier) Davlieva, Milya G.; Tovar-Yanez, Angel; DeBruler, Kimberly; Leonard, Paul G.; Zianni, Michael R.; Arias, César A.; Shamoo, Yousif
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    Analysis of clonality and antibiotic resistance among early clinical isolates of enterococcus faecium in the United States
    (Infectious Diseases Society of America, 2009) Galloway-Pena, Jessica; Nallapareddy, Sreedhar R.; Arias, César A.; Eliopoulos, George M.; Beral, Valerie
    Antecedentes: el genogrupo de Enterococcus faecium, denominado complejo clonal 17 (CC17), parece poseer múltiples determinantes que aumentan su capacidad para sobrevivir y causar enfermedades en ambientes nosocomiales. Métodos: Utilizando 53 aislados de E. faecium de EE. UU. Clínicamente y geográficamente diversos que datan de 1971 a 1994, se determinó el tipo de secuencia multilocus; la presencia de 16 genes de virulencia putativos (hyl Efm , esp Efmy genes fms); resistencia a ampicilina (AMP) y vancomicina (VAN); y resistencia de alto nivel a gentamicina y estreptomicina. Resultados: En general, se identificaron 16 tipos de secuencia (ST) diferentes, en su mayoría aislados CC17, en 9 regiones diferentes de los Estados Unidos. Los primeros aislamientos de CC17 fueron parte de un brote que ocurrió en 1982 en Richmond, Virginia. Las características de los aislados de CC17 incluyeron aumentos en la resistencia al AMP, la presencia de hyl Efm y esp Efm., aparición de resistencia a VAN y presencia de al menos 13 de 14 genes fms. Sin embargo, ocho de 41 de los primeros aislados con resistencia a AMP no estaban en CC17. Conclusiones: Aunque no todos los primeros aislamientos de AMP de EE. UU. Estaban relacionados clonalmente, los aislamientos de E. faecium CC17 han estado circulando en los Estados Unidos desde al menos 1982 y parecen haber adquirido progresivamente determinantes adicionales de virulencia y resistencia a los antibióticos, lo que quizás explica el éxito reciente de esta especie. en el entorno hospitalario.
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    Antibiotic-resistant bugs in the 21st century - A clinical super-challenge
    (Massachussetts Medical Society, 2009) Arias, César A.; Beral, Valerie
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    Bacteriophage-antibiotic combinations for Enterococcus faecium with Varying Bacteriophage and Daptomycin Susceptibilities
    (American Society for Microbiology, 2020) Morrisette, Taylor; Lev, Katherine L.; Kebriaei, Razieh; Abdul-Mutakabbir, Jacinda C.; Stamper, Kyle; Morales, Sandra; Lehman, Susan; Canfield, Gregory; Duerkop, Breck; Arias, César A.; Rybak, Michael Joseph
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    Ceftaroline-resistant, daptomycin-tolerant, and heterogeneous vancomycin-intermediate methicillin-resistant Staphylococcus aureus causing infective endocarditis
    (American Society for Microbiology, 2017) Nigo, Masayuki; Diaz, Lorena; Carvajal Ortiz, Lina Paola; Tran, Truc T.; Rios, Rafael; panesso, diana; Garavito, Juan D.; Miller, William R.; Wanger, Audrey R.; Weinstock, George; Munita, Jose M.; Arias, César A.; Chambers, Henry; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; Carvajal Ortiz, Lina Paola [0000-0001-8301-8836]
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    Characterization of macrolide resistance in Gram-positive cocci from Colombian hospitals: a countrywide surveillance
    (Elsevier, 2007) Reyes, Jinnethe; Hidalgo, Marylin; Diaz, Lorena; Rincon Núñez, Sandra; Moreno, Jaime Enrique; Vanegas, Natasha; Castañeda, Elizabeth; Arias, César A.; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]
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    Cotransferencia de genes de resistencia a antibióticos y un plásmido de virulencia que contiene hyl Efm en Enterococcus faecium
    (American Society for Microbiology) Arias, César A.; panesso, diana; Singh, Kavindra V.; Rice, Louis B.; Beral, Valerie; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]
    El gen hyl Efm (que codifica una supuesta hialuronidasa) se ha encontrado casi exclusivamente en aislados clínicos de Enterococcus faecium y, recientemente, se ha demostrado que se encuentra en un plásmido que aumenta la capacidad de las cepas de E. faecium para colonizar el tracto gastrointestinal. En este trabajo, los resultados de los experimentos de apareamiento entre cepas de E. faecium que contienen hylz Efm pertenecientes al grupo clonal 17 y aisladas en los Estados Unidos y Colombia indicaron que el hyl EfmEl gen de estas cepas también se transporta en plásmidos grandes (> 145 kb) que mostramos que se transfieren fácilmente de cepas clínicas a huéspedes de E. faecium. También se observó cotransferencia de resistencia a vancomicina y resistencia de alto nivel (HLR) a aminoglucósidos (gentamicina y estreptomicina) y eritromicina. El grupo de genes vanA y los determinantes de resistencia a la gentamicina estaban genéticamente vinculados a hyl Efm , mientras que erm (B) y ant (6) -I, que confieren resistencia a macrólido-lincosamida-estreptogramina B y HLR a estreptomicina, respectivamente, no lo estaban. Un hyl EfmEl transconjugante positivo resultante de un apareamiento entre una cepa de endocarditis bien caracterizada [TX0016 (DO)] y un derivado de una cepa fecal de E. faecium de un voluntario humano sano (TX1330RF) exhibió una mayor virulencia en un modelo de peritonitis de ratón. Estos resultados indican que las cepas de E. faecium utilizan una estrategia que implica el reclutamiento en la misma unidad genética de genes de resistencia a antibióticos y determinantes que aumentan la capacidad de producir enfermedades. Nuestros hallazgos indican que la adquisición de los plásmidos hyl Efm puede explicar, al menos en parte, la reciente aparición exitosa de algunas cepas de E. faecium como patógenos nosocomiales.
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    Daptomycin dose-ranging evaluation with single-dose versus multidose ceftriaxone combinations against streptococcus mitis/ oralis in an ex vivo simulated endocarditis vegetation model
    (American Society for Microbiology, 2019) Kebriaei, Razieh; Rice, Seth A.; Stamper, Kyle; Seepersaud, Ravin; García-De-La-Mària, Cristina; Mishra, Nagendra Nath; Miró, José Mª; Arias, César A.; Tran, Truc T; Sullam, Paul M.; Bayer, Arnold; Rybak, Michael Joseph
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    Daptomycin-resistant enterococcus faecalis diverts the antibiotic molecule from the division septum and remodels cell membrane phospholipids
    (American Society for Microbiology, 2013) Tran, Truc T.; Panesso, Diana; Mishra, Nagendra N.; Mileykovskaya, Eugenia; Guan, Ziqianq; Munita, José M.; Reyes, Jinnethe; Díaz, Lorena; Weinstock, George M.; Murray, Barbara E; Shamoo, Yousif; Dowhan, William; Bayer, Arnold S.; Arias, César A.; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]
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    Detection of heterogeneous vancomycin intermediate resistance in MRSA isolates from Latin America
    (Oxford University Press, 2020) Castro, Betsy Esperanza; Berrío, Maritza; Vargas, Monica L.; Carvajal Ortiz, Lina Paola; Millan, Lina V.; Rios, Rafael; Hernandez, Angie K.; Rincon Núñez, Sandra; Cubides, Paola; Forero, Erika; Dinh, An Q; Seas, Carlos; Munita, Jose M.; Arias, César A.; Reyes, Jinnethe; Diaz, Lorena; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]; Carvajal Ortiz, Lina Paola [0000-0001-8301-8836]
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    Dinámica de la población de SARM en un hospital chileno: un análisis filogenómico (2000-2016)
    (Genomics & Resistant Microbes (GeRM), ICIM, Facultad de Medicina Clínica Alemana, Universidad del Desarrollo, Santiago, Chile, 2023) Martínez, José R.W.; Planet, Paul J.; Spencer Sandino, Maria; Rivas, Lina; Díaz, Lorena; Moustafa, Ahmed M.; Quesille Villalobos, Ana; Riquelme Neira, Roberto; Alcalde Rico, Manuel; Hanson, Blake; Carvajal, Lina P.; Rincón, Sandra; Reyes, Jinnethe; Lam, Marusella; Calderón, Juan F.; Araos, Rafael; García, Patricia; Arias, César A.; Munita, José M.; Alcalde Rico, Manuel [0000-0002-1987-4600]; Rincón, Sandra [0000-0002-8482-4554]; Reyes, Jinnethe [0000-0002-1722-0734]
    La diseminación mundial de Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) está asociada a la aparición y el establecimiento de clones en zonas geográficas específicas. El clon chileno-cordobés (ChC) (ST5-SCCmecI) ha sido el clon de SARM predominante en Chile desde su primera descripción en 1998, a pesar del informe de otros clones de SARM emergentes en los últimos años. Aquí, caracterizamos la historia evolutiva de MRSA desde 2000 hasta 2016 en un centro de salud terciario chileno utilizando análisis filogenómicos. Secuenciamos 469 aislamientos de SARM recogidos entre 2000 y 2016. Evaluamos las tendencias temporales de los clones circulantes y realizamos una reconstrucción filogenómica para caracterizar la dinámica clonal. Encontramos un aumento significativo en la diversidad y riqueza de tipos de secuencia (STs; Spearman r = 0,8748, P , 0,0001) con un índice de diversidad de Shannon que aumentó de 0,221 en el año 2000 a 1,33 en 2016, y una diversidad efectiva (número de Hill; q = 2) que aumentó de 1,12 a 2,71. El análisis de la tendencia temporal reveló que en el periodo de 2000 a 2003 la mayoría de los aislados (94,2%; n = 98) pertenecían al clon ChC. Sin embargo, desde entonces, la frecuencia del clon ChC ha disminuido con el tiempo, representando el 52% de la colección en el período de 2013 a 2016. Este descenso estuvo acompañado por el aumento de dos linajes emergentes de SARM, ST105-SCCmecII y ST72-SCCmecVI. En conclusión, el clon ChC sigue siendo el linaje MRSA más frecuente, pero este linaje está siendo reemplazado gradualmente por varios clones emergentes, el más importante de los cuales es el clon ST105-SCCmecII. Hasta donde sabemos, éste es el mayor estudio de la dinámica clonal del SARM realizado en Sudamérica. © 2023 Martínez et al.
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    Dissemination of methicillin-resistant staphylococcus aureus USA300 sequence type 8 lineage in Latin America
    (Infectious Diseases Society of America, 2009) Reyes, Jinnethe; Rincon Núñez, Sandra; Diaz, Lorena; Panesso, Diana; Contreras, Germán A.; Zurita, Jeannete; Carrillo, Carlos; Rizzi, Adele; Guzmán, Manuel; Adachi, Javier A.; Chowdhury, Shahreen A.; Beral, Valerie; Arias, César A.; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]
    Antecedentes. Staphylococus aureus resistente a la meticilina (MRSA) es un patógeno nosocomial y asociado a la comunidad (CA) importante. Recientemente, una variante del clon MRSA USA300 surgió y se diseminó en América del Sur, causando importantes problemas clínicos. Métodos. Se recolectaron prospectivamente aislamientos de S. aureus (2006-2008) de 32 hospitales terciarios en Colombia, Ecuador, Perú y Venezuela. Los aislados de MRSA se sometieron a pruebas de susceptibilidad a los antimicrobianos y electroforesis en gel de campo pulsado y se clasificaron como clones similares a los de la atención médica (HA) o CA según las características genotípicas y la detección de genes que codifican la leucocidina Panton-Valentine y el cromosoma del casete de estafilococos ( SCC) mec IV. Además, se realizó la tipificación de secuencias multilocus de aislados representativos de cada pulsotipo CAMRSA principal, y se investigó la presencia de toxinas asociadas con USA300 y el gen arcA para todos los aislamientos categorizados como CA-MRSA. Resultados. Se incluyó un total de 1570 S. aureus; 651 eran MRSA (41%) - con la tasa más alta de aislamiento de MRSA en Perú (62%) y la más baja en Venezuela (26%) - y el 71%, 27% y 2% se clasificaron como HA-like, CA- clones similares y no similares a CA / HA, respectivamente. Se confirmó que solo 9 aislados de MRSA tenían una susceptibilidad reducida a los glicopéptidos (fenotipo de S. aureus intermedio con glicopéptidos). El pulsotipo más común (designado ComA) entre las cepas de MRSA similares a CA se encontró en el 96% de los aislados, y la mayoría (81%) tiene una diferencia de banda ≤ S6 con la cepa USA300-0114. Los aislados representativos de este clon fueron el tipo de secuencia 8; sin embargo, a diferencia de la cepa USA300-0114, albergaban un subtipo diferente de SCCmec IV y carecían de arcA (un indicador del elemento móvil catabólico de arginina). Conclusión. Se ha establecido una variante del clon CA-MRSA USA300 en América del Sur y, en algunos países, es endémica en entornos hospitalarios.
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    Dynamics of blaKPC-2 dissemination from non-CG258 Klebsiella pneumoniae to other Enterobacterales via IncN plasmids in an area of high endemicity
    (American Society for Microbiology, 2020) Rada, Ana M; de la Cadena, Elsa; Agudelo Restrepo, Carlos Andrés; Capataz, Cesar; Orozco, Nataly; Pallares, Christian José; Dinh, An Q; panesso, diana; Rios, Rafael; Diaz, Lorena; Feltrin Correa, Adriana Aparecida; Hanson, Blake M; Villegas, María Virginia; Arias, César A.; Restrepo, Eliana; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; de la Cadena, Elsa [0000-0003-0361-7893]; Pallares, Christian José [0000-0002-6093-7845]; Villegas, María Virginia [0000-0003-1898-9067]
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    Enterococcal endocarditis: can we win the war?
    (Springer Nature, 2012) Munita, Jose M.; Arias, César A.; Beral, Valerie
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    First characterization of a cluster of VanA-Type glycopeptide-resistant Enterococcus faecium, Colombia
    (Centers for Disease Control and Prevention, 2015) Panesso, Diana; Ospina, Sigifredo; Robledo, Jaime; Vela, María Claudia; Peña, Julieta; Hernández, Orville; Reyes, Jinnethe; Arias, César A.; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]
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    Genomic and epidemiological evidence of a dominant panton-valentine leucocidin-positive methicillin resistant staphylococcus aureus lineage in Sri Lanka and presence among isolates from the United Kingdom and Australia
    (Frontiers Media, 2019) McTavish, Sharla M.; Snow, Sarah J.; Cook, Ellie C.; Pichon, Bruno; Coleman, Sarah; Coombs, Geoffrey W.; Pang, Stanley; Arias, César A.; Díaz, Lorena; Boldock, Emma; Davies, Steve; Udukala, Mangala; Kearns, Angela Marie; Siribaddana, Sisira; De Silva, Thushan I.
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    Guías para el uso racional de antibióticos ß-lactámicos: mecanismos de resistencia y su interpretación clínica
    (Instituto Nacional de Salud, 2003) Arias, César A.; Panesso, Diana; Zúñiga, Mauricio; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]
    Los antibióticos ß-lactámicos son los compuestos más ampliamente usados para tratar infecciones adquiridas en el hospital o en la comunidad. Sin embargo, la resistencia a estos antibióticos en bacterias Gram negativas y Gram positivas se ha incrementado, lo cual limita su eficacia terapéutica. Se debe estar alerta a este fenómeno y seleccionar la terapia de acuerdo con el mecanismo de resistencia probable del germen aislado. La lectura interpretativa de los patrones de susceptibilidad permite un enfoque más racional del problema de resistencia y se convierte en una guía fundamental para el manejo de situaciones específicas. Dada la complejidad de los mecanismos de resistencia, es indispensable que el laboratorio identifique los microorganismos según especie y determine la susceptibilidad de un número razonable de antimicrobianos. La resistencia a ß-lactámicos en Enterobacteriaceae se debe principalmente a la producción de ß-lactamasas codificadas cromosómicamente o en plásmidos. Los mecanismos de impermeabilidad y la producción de bombas de exclusión molecular son los más comunes en microorganismos 'no fermentadores', por lo cual la terapia debe responder a estos fenómenos. En bacterias Gram positivas existen varios mecanismos involucrados: producción de proteínas de unión a penicilina (PBP) alteradas, síntesis de nuevas PBP o producción de ß-lactamasas. Se discuten aquí las opciones terapéuticas basadas en el conocimiento de los mecanismos de resistencia.
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    Hypervirulent group A Streptococcus emergence in an acaspular background is associated with marked remodeling of the bacterial cell surface
    (Public Library of Science, 2018) Galloway Peña, Jessica; DebRoy, Sruti; Brumlow, Chelcy; Li, Xiqi; Tran, Truc T.; Horstmann, Nicola; Yao, Hui; Chen, Ken; Wang, Fang; Pan, Bih-Fang; Hawke, David H.; Thompson, Erika J.; Arias, César A.