A trilocus sequence typing scheme for hospital epidemiology and subspecies differentiation of an important nosocomial pathogen, Enterococcus faecalis

Vista sencilla de ítem
dc.contributor.authorChowdhury, Shahreen A.
dc.contributor.authorArias, César A.
dc.contributor.authorNallapareddy, Sreedhar R.
dc.contributor.authorReyes, Jinnethe
dc.contributor.authorWillems, Rob J. L.
dc.contributor.authorBeral, Valerie
dc.date.accessioned2021-02-22T14:55:11Z
dc.date.available2021-02-22T14:55:11Z
dc.date.issued2009
dc.description.abstractEn este estudio, presentamos un esquema de tipificación de secuencia trilocus (TLST) basado en regiones intragénicas de dos genes antigénicos, ace y salA (que codifican una adhesina de colágeno / laminina y un antígeno asociado a la pared celular, respectivamente), y un gen asociado con antibiótico resistencia, lsa (que codifica un transportador ABC putativo), para la diferenciación de subespecies de Enterococcus faecalis. Cada uno de los alelos se analizó utilizando 50 aislamientos de E. faecalis que representan 42 tipos de secuencias multilocus diversos (ST M; basado en siete genes de mantenimiento) y cuatro grupos de aislados unidos clonalmente (por electroforesis en gel de campo pulsado [PFGE]). Los perfiles alélicos y / o secuencias concatenadas de los tres genes coincidieron con los resultados de la tipificación de secuencias multilocus (MLST) para la tipificación de 49 de los 50 aislamientos; Además de la única excepción, se encontró que dos aislamientos tenían tipos de TLST idénticos pero eran variantes de un solo locus (que se diferenciaban por un solo nucleótido) según MLST y, por lo tanto, también se clasificaron como relacionados clonalmente por MLST. TLST también fue comparable a PFGE para establecer relaciones epidemiológicas a corto plazo, tipificando todos los aislados clasificados como relacionados clonalmente por PFGE con el mismo tipo. A continuación, se aplicó TLST a aislamientos representativos (de cada subtipo de PFGE y año de aislamiento) de una colección de 48 aislamientos hospitalarios y se demostraron las mismas relaciones entre los aislamientos de una cepa del brote que los encontrados por MLST y PFGE. En conclusión, el esquema TLST descrito aquí demostró ser exitoso para investigar la epidemiología a corto plazo en un entorno hospitalario y puede proporcionar una alternativa a MLST para discriminar aislamientos.spa
dc.description.abstractenglishIn this study, we present a trilocus sequence typing (TLST) scheme based on intragenic regions of two antigenic genes, ace and salA (encoding a collagen/laminin adhesin and a cell wall-associated antigen, respectively), and a gene associated with antibiotic resistance, lsa (encoding a putative ABC transporter), for subspecies differentiation of Enterococcus faecalis. Each of the alleles was analyzed using 50 E. faecalis isolates representing 42 diverse multilocus sequence types (STM; based on seven housekeeping genes) and four groups of clonally linked (by pulsed-field gel electrophoresis [PFGE]) isolates. The allelic profiles and/or concatenated sequences of the three genes agreed with multilocus sequence typing (MLST) results for typing of 49 of the 50 isolates; in addition to the one exception, two isolates were found to have identical TLST types but were single-locus variants (differing by a single nucleotide) by MLST and were therefore also classified as clonally related by MLST. TLST was also comparable to PFGE for establishing short-term epidemiological relationships, typing all isolates classified as clonally related by PFGE with the same type. TLST was then applied to representative isolates (of each PFGE subtype and isolation year) of a collection of 48 hospital isolates and demonstrated the same relationships between isolates of an outbreak strain as those found by MLST and PFGE. In conclusion, the TLST scheme described here was shown to be successful for investigating short-term epidemiology in a hospital setting and may provide an alternative to MLST for discriminating isolates.eng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1128/JCM.00667-09
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.issn1098-660X
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/5403
dc.language.isoeng
dc.publisherAmerican Society for Microbiologyspa
dc.publisher.journalJournal of Clinical Microbiologyspa
dc.relation.ispartofseriesJournal of Clinical Microbiology, 1098-660X, Vol. 47; Nro. 9, 2009, p. 2713-2719spa
dc.relation.urihttps://jcm.asm.org/content/47/9/2713
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsAcceso abierto
dc.rights.creativecommons2009
dc.rights.localAcceso abiertospa
dc.subjectTécnicas de tipificación bacterianaspa
dc.subjectInfección cruzadaspa
dc.subjectHuella de ADNspa
dc.subjectEnterococcus faecalisspa
dc.subjectInfecciones bacterianas grampositivasspa
dc.subject.keywordsBacterial typing techniquesspa
dc.subject.keywordsCross infectionspa
dc.subject.keywordsDNA fingerprintingspa
dc.subject.keywordsEnterococcus faecalisspa
dc.subject.keywordsGram-positive bacterial infectionsspa
dc.titleA trilocus sequence typing scheme for hospital epidemiology and subspecies differentiation of an important nosocomial pathogen, Enterococcus faecalisspa
dc.title.translatedA trilocus sequence typing scheme for hospital epidemiology and subspecies differentiation of an important nosocomial pathogen, Enterococcus faecalisspa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/article
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.localArtículo de revista

Archivos

Bloque original
Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
Chowdhury_Shahreen_A_2009.pdf
Tamaño:
735.91 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descripción:
Descargar
Bloque de licencias
Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
license.txt
Tamaño:
1.71 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descripción:
Descargar

Colecciones

Artículos