Identificación de genotipos del virus de la hepatitis b y mutaciones en los genes p y s, a partir de muestras de sueros procedentes de treinta y dos departamentos de Colombia, 2002 – 2014.

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dc.contributor.advisorPeláez Carvajal, Dioselina
dc.contributor.advisorLaiton Donato, Katherine
dc.contributor.authorForero Castro, Nidia Janeth
dc.creator.degreetypeFijo mayor a un añospa
dc.date.accessioned2019-08-16T15:07:05Z
dc.date.available2019-08-16T15:07:05Z
dc.date.issued2017
dc.description.abstractLa hepatitis B es una enfermedad causada por el virus de la hepatitis B (VHB) que es el tipo más grave de hepatitis vírica en todo el mundo constituyéndose así en un importante problema de salud pública. Se estima que 257 millones de personas están infectadas crónicamente con el virus de hepatitis B y que todavía hay acceso limitado al diagnóstico y tratamiento de la hepatitis B en muchos contextos con recursos limitados. En Colombia el patrón de endemicidad es heterogéneo con circulación de diferentes genotipos virales. El virus de hepatitis B tiene una alta tasa de mutaciones a lo largo del genoma que le confieren resistencia a la terapia antiviral o le permiten escapar de la respuesta inmune del hospedero tras la vacunación o por infección natural y en otros casos causar infección oculta y progresión a carcinoma hepatocelular (CHC). Identificar genotipos del virus de la hepatitis B (VHB) y mutaciones en los genes S y P en muestras de la seroteca del laboratorio de virología del Instituto Nacional de Salud recolectadas de los treinta y dos departamentos de Colombia durante el período 2002 a 2014. A partir de 495 muestras de suero positivas para HBsAg se realizó detección molecular y posteriormente secuenciación de una región de 1591 nucleótidos correspondiente a los genes P y S. Finalmente se realizó análisis filogenético e identificación de mutaciones de resistencia y escape. En 66 muestras (13,3%) se logró la detección molecular del genoma viral y 28 muestras (42,4%) fueron exitosamente secuenciadas. El análisis filogenético permitió identificar los genotipos/subgenotipos F3 y A2. La muestra 49884_Cundinamarca_CO_2003 presentó simultáneamente las sustituciones asociadas con resistencia L180M y M204V, mientras que la muestra 60265_Cesar_CO_2004 presentó la mutación de resistencia I169L. Se identificó la mutación P120Q en la muestra 48877_Guaviare_CO_2002. Dos de las muestras presentaron una deleción de 105 nucleótidos en la región preS1-preS2. Se confirmó la circulación en Colombia de los genotipos/subgenotipos F3 y A2, y se detectó presencia de mutaciones de resistencia y escape. El presente estudio constituye un aporte en la epidemiologia molecular del VHB en Colombia y la búsqueda de mutaciones en los genes seleccionados es valiosa durante la toma de decisiones en la elección de la terapia antiviral.spa
dc.description.abstractenglishHepatitis B is a disease caused by the hepatitis B virus (HBV), which is the most serious type of viral hepatitis in the world, constituting itself in an important public health problem. It is estimated that 257 million people are chronically infected with the hepatitis B virus and that there is still limited access to the diagnosis and treatment of hepatitis B in many resource-limited settings. In Colombia the pattern of endemicity is heterogeneous with circulation of different viral genotypes. The hepatitis B virus has a high rate of mutations throughout the genome that confers resistance to antiviral therapy or allow it to escape the host immune response after vaccination or by natural infection and in other cases causes occult infection and progression to hepatocellular carcinoma (CHC). A total of 495 serum samples with previous HBsAg reactive result were used for molecular detection. A 1591 nucleotides region corresponding to the P (partial) and S genes was sequenced from the PCR-amplified samples. Phylogenetic analysis was performed for genotyping and escape mutations was identificated. In 66 samples (13, 3%) the viral genome of VHB was detected. Twenty-eight samples (42, 4%) were successfully sequenced. The phylogenetic analysis allowed the identification of subgenotypes F3 and A2. The sample identified as 49884_Cundinamarca_CO_2003 simultaneously showed the mutations associated with resistance L180M and M204V, while 60265_Cesar_CO_2004 showed the resistance mutation I169L. A single escape mutation, P120Q was identified in 48877_Guaviare_CO_2002. Two samples showed a deletion of 105 nucleotides in the preS1-preS2 region. The circulation of genotypes/subgenotypes F3 and A2 of VHB in Colombia was confirmed, as well as the presence of some resistance and escape mutations. The present study constitutes a contribution in the molecular epidemiology of HBV in Colombia and the search for mutations in the selected genes is valuable during decision making about antiviral therapy.eng
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameMagíster en Ciencias Básicas Biomédicasspa
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/1624
dc.language.isospa
dc.publisher.facultyFacultad de Cienciasspa
dc.publisher.grantorUniversidad El Bosquespa
dc.publisher.programMaestría en Ciencias Básicas Biomédicasspa
dc.rightsAttribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International*
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons2017
dc.rights.localAcceso abiertospa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/*
dc.subject.nlmW 50spa
dc.titleIdentificación de genotipos del virus de la hepatitis b y mutaciones en los genes p y s, a partir de muestras de sueros procedentes de treinta y dos departamentos de Colombia, 2002 – 2014.spa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisspa
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionspa
dc.type.localTrabajo de gradospa
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradospa

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