Maestría en Ciencias Básicas Biomédicas

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https://hdl.handle.net/20.500.12495/158

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Examinando Maestría en Ciencias Básicas Biomédicas por Materia "Antibiotic"

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    Cambio en el microbioma bacteriano intestinal de niños menores de 3 años después de un tratamiento con antibióticos
    (2024-07) Peña Cardenas, Paola Andrea; Abril Riaño, Deisy Abril
    El microbioma es un conjunto de microorganismos que existen e interactúan en un entorno particular, y que comprende también sus genomas y metabolitos producidos; su diversidad y abundancia cambian de acuerdo con factores ambientales como la alimentación, consumo de medicamentos (antibióticos y muchos otros), respuesta del hospedero, estrés fisicoquímico y otros. Los estudios sobre el microbioma humano se han basado en cinco sitios principales, piel, vías respiratorias, cavidad oral, tracto vaginal e intestino, este último siendo uno de los más estudiados en todo el mundo por su relación con diversos tipos de infecciones y enfermedades. En Colombia, las investigaciones de microbioma intestinal en lactantes son escasas y se desconocen los cambios generados por el uso de antibióticos. Por ende, el objetivo de este estudio fue establecer los cambios en el microbioma intestinal de niños menores de 3 años y mayores de 6 meses, con infecciones bacterianas que requirieron el uso de antibióticos. Se reclutaron 32 pacientes que fueron atendidos en una institución de salud de tercer nivel y que requirieron tratamiento antibiótico. De cada uno de ellos, se obtuvieron tres muestras de material fecal a diferentes tiempos: antes del inicio del tratamiento (tiempo 0, pre-antibiótico), al finalizar el tratamiento (7 días) y 30 días después (recuperación post-antibiótico). Debido a la falta de estudios de microbioma en niños, una muestra de un grupo control de 30 niños fue incluida (tiempo 0). La diversidad del microbioma fue establecida por secuenciación de los genes 16S-ITS-23S-ARNr (PacBio). Las lecturas HiFi se analizaron usando SBanalyzer-Athena™ para clasificación de cepas y QIIME2-DADA2 (SILVA-RDP-GTDB) para especie, y los análisis estadísticos se realizaron con R, STAMP y Prisma-GraphPad. Los filos Bacillota (Firmicutes), Bacteroidota (Bacteroidetes), Pseudomonadota (Proteobacteria) y Actinomycetota fueron los más abundantes al inicio (33,0%, 42,6%, 10,9% y 12,5%, respectivamente) cuya composición fue similar al grupo sano; estos filos fueron los que presentaron los mayores cambios con el consumo de los antibióticos. Para destacar, el uso de antibióticos produjo una considerable disminución de Bifidobacterium spp. principalmente Bifidobacterium pseudocatenulatum (p=0,0018, DBM= 8.77), y que al mes no alcanzó una completa recuperación. La reducción observada de especies benéficas comensales por los antibióticos evidencia la perturbación del microbioma intestinal y la necesidad de evaluar la posible inclusión de probióticos durante o después del tratamiento antibiótico en población pediátrica.