Examinando por Autor "Vargas, Carlos"

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    Application of Comprehensive Genomic Profiling-Based Next-Generation Sequencing Assay to Improve Cancer Care in a Developing Country
    (SAGE, 2023) Cifuentes, Claudia; Lombana, Milton; Vargas, Henry; Laguado, Paola; Ruiz Patiño, Alejandro; Rojas, Leonardo; Navarro, Uriel; Vargas, Carlos; Ricaurte, Luisa; Arrieta, Oscar; Zatarain Barron, Lucia; Zapata, Leandro; González, Guido; Ortiz, Carlos; Bernal, Laura; Restrepo, Juan G.; Viola, Lucia; Grosso, Fabio; Zapata, Ricardo; Mantilla, William; Carranza, Hernán; Bustillo, Iván; Llinas, Néstor; Duarte, Ricardo; Rodríguez, July; Archila, Pilar; Ávila, Jenny; Bermúdez, Maritza; Gámez, Tatiana; Sotelo, Carolina; Otero, Jorge; Forero, Elkin; Lema, Mauricio; Limpias, Catalina; Ordóñez Reyes, Camila; Mejía, Sergio; Rolfo, Christian; Rosell, Rafael; Cardona, Andrés F.; Ordóñez Reyes, Camila [0000-0002-8941-9064]
    Propósito: La identificación de mutaciones oncogénicas procesables ha cambiado el panorama terapéutico en diferentes tipos de tumores. Este estudio investigó la utilidad del perfil genómico integral (CGP), un ensayo híbrido de secuenciación de próxima generación (NGS) basado en la captura, en la práctica clínica en un país en desarrollo. Métodos: En este estudio de cohortes retrospectivo, se realizó CGP en muestras clínicas de pacientes con diferentes tumores sólidos reclutados entre diciembre de 2016 y noviembre de 2020, utilizando perfiles genómicos basados en captura híbrida, a petición de los médicos tratantes individuales en la atención clínica para las decisiones terapéuticas. Se estimaron curvas de supervivencia de Kaplan-Meier para caracterizar las variables de tiempo hasta el evento. Resultados: La mediana de edad de los pacientes fue de 61 años (rango: 14-87 años), y el 64,7% eran mujeres. El diagnóstico histológico más frecuente fue el de tumor primario de pulmón, con 90 pacientes correspondientes al 52,9% de las muestras (IC 95%: 45,4-60,4%). Se identificaron mutaciones procesables con medicamentos aprobados por la FDA para alteraciones específicas correspondientes a la histología tumoral en 58 casos (46,4%), mientras que se detectaron otras alteraciones en 47 muestras diferentes (37,6%). La mediana de supervivencia global fue de 15,5 meses (IC 95%: 11,7 meses-NR). Los pacientes sometidos a evaluación genómica en el momento del diagnóstico alcanzaron una mediana de supervivencia global de 18,3 meses (IC 95% 14,9 meses-NR) en comparación con 14,1 meses (IC 95% 11,1 meses-NR) en los pacientes que obtuvieron la evaluación genómica tras la progresión tumoral y durante el tratamiento estándar (P =,7). Conclusiones: CGP de diferentes tipos de tumores identifica alteraciones genómicas clínicamente relevantes que se han beneficiado de la terapia dirigida y mejorar la atención del cáncer en un país en desarrollo para guiar el tratamiento personalizado a los resultados beneficiosos de los pacientes con cáncer.
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    Genomic Landscape of Primary Resistance to Osimertinib Among Hispanic Patients with EGFR-Mutant Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC): Results of an Observational Longitudinal Cohort Study
    (Springer Nature, 2023) Chamorro, Diego F.; Cardona, Andrés F.; Rodríguez, July; Ruiz Patiño, Alejandro; Arrieta, Oscar; Moreno Pérez, Darwin A.; Rojas, Leonardo; Zatarain Barrón, Zyanya Lucia; Ardila, Dora V.; Viola, Lucia; Recondo, Gonzalo; Blaquier, Juan B.; Martín, Claudio; Raez, Luis; Samtani, Suraj; Ordóñez Reyes, Camila; Garcia Robledo, Juan Esteban; Corrales, Luis; Sotelo, Carolina; Ricaurte, Luisa; Cuello, Mauricio; Mejía, Sergio; Jaller, Elvira; Vargas, Carlos; Carranza, Hernán; Otero, Jorge; Archila, Pilar; Bermudez, Maritza; Gamez, Tatiana; Russo, Alessandro; Malapelle, Umberto; de Miguel Perez, Diego; de Lima, Vladmir C. Cordeiro; Helano, Freitas; Freitas, Helano; Saldahna, Erick; Rolfo, Christian; Rosell, Rafael
    Antecedentes: Las mutaciones del receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFRm) representan una de las alteraciones genómicas más comunes identificadas entre los pacientes con cáncer de pulmón no microcítico (CPNM). Se ha demostrado la seguridad y eficacia de varios fármacos dirigidos a pacientes con EGFRm, entre ellos el inhibidor de la tirosina cinasa (ITC) de tercera generación osimertinib. No obstante, algunos pacientes presentarán o desarrollarán mecanismos de resistencia al EGFR-TKI. Objetivo: Caracterizamos el panorama genómico de la resistencia primaria a osimertinib entre pacientes hispanos con CPNM EGFR-mutante. Métodos: Se realizó un estudio longitudinal observacional de cohortes con dos grupos de pacientes, aquellos con resistencia intrínseca (cohorte A) y aquellos con supervivencia a largo plazo (cohorte B). Todos los pacientes fueron tratados y seguidos entre enero de 2018 y mayo de 2022. A todos los pacientes se les evaluó la expresión del ligando de muerte celular programada 1 (PD-L1) y la expresión del ARNm de la proteína similar a Bcl-2 11 (BIM)/AXL antes de iniciar el TKI. Tras 8 semanas de tratamiento, se realizó una biopsia líquida para determinar la presencia de ADN libre circulante (cfADN), y se utilizó la secuenciación de nueva generación (NGS) para identificar mutaciones en el momento de la progresión. En ambas cohortes se evaluaron la tasa de respuesta global (TRG), la supervivencia sin progresión (SLP) y la supervivencia global (SG). Resultados: Encontramos una distribución homogénea de mutaciones sensibilizantes al EGFR en ambas cohortes. En la cohorte A, las mutaciones del exón 21 fueron más frecuentes que las deleciones del exón 19 (ex19dels) en la cohorte B (P = 0,0001). La RRO comunicada para osimertinib fue del 6,3% y del 100% para las cohortes A y B, respectivamente (P = 0,0001). La SLP fue significativamente mayor en la cohorte B (27,4 meses frente a 3,1 meses; P = 0,0001) y en los pacientes ex19del frente a L858R (24,5 meses, intervalo de confianza [IC] del 95%: 18,2-NR), frente a 7,6 meses, IC del 95%: 4,8-21,1; P = 0,001). La SG fue considerablemente inferior en la cohorte A (20,1 meses frente a 36,0 meses; P = 0,0001) y fue mejor en los pacientes con ex19del, sin metástasis cerebral y con baja carga de mutación tumoral. En el momento de la progresión, se encontraron más mutaciones en la cohorte A, identificándose con mayor frecuencia alteraciones fuera del objetivo, incluyendo TP53, RAS y RB1. Conclusiones: Las alteraciones independientes del EGFR son comunes entre los pacientes con resistencia primaria a osimertinib e impactan significativamente en la SLP y la SG. Nuestros resultados sugieren que entre los pacientes hispanos, otras variables asociadas con la resistencia intrínseca incluyen el número de conmutaciones, niveles altos de ARNm de AXL y niveles bajos de ARNm de BIM, T790M de novo, presencia de EGFR p.L858R y una carga mutacional tumoral elevada.
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    Impact of COVID-19 infection on patients with Cancer: experience in a Latin American Country: The ACHOCC-19 Study
    (Wiley, 2021) Ospina, Aylen Vanessa; Brugues, Ricardo; Mantilla, William; Triana, Iván; Ramos, Pedro; Aruachan, Sandra; Quiroga, Alicia; Munevar, Isabel; Ortiz, Juan; Llinás, Néstor; Pinilla, Paola; Vargas, Henry; Idrobo, Henry; Russi, Andrea; Manneh Kopp, Ray; Rivas, Giovanna; González, Héctor; Santa, Daniel; Insuasty, Jesús; Bernal, Laura; Otero, Jorge; Vargas, Carlos; Pacheco, Javier; Alcalá, Carmen; Jiménez, Paola; Lombana, Milton; Contreras, Fernando; Segovia, Javier; Pino, Luis; Lobatón, José; González, Manuel; Cuello, Javier; Bogoya, Juliana; Barrero, Angela; de Lima Lopes Jr, Gilberto