Examinando por Autor "Vanegas, Natasha"
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Ítem 3D tissue culture- a more efficient and predictive model for the assessment of EDVTMnanocell delivery to tumours(Wiley, 2014) Mugridge, Nancy; Vanegas, Natasha; Pattison, Stacey; Smolarczyk, Katarzyna; Brahmbhatt, Himanshu; MacDiarmid, JenniferComo primer puerto de escala para evaluar el valor terapéutico de un compuesto, el cultivo de tejidos es una herramienta crítica. Sin embargo, la falta de semejanza del cultivo tisular bidimensional (2D) tradicional con los modelos tumorales siempre ha demostrado ser un factor limitante, y más aún para las terapias dirigidas basadas en partículas que dependen más de la estructura del tejido natural para la unión y la administración. Con la aparición de varios modelos 3D in vitro, se pueden realizar estudios en esferoides tumorales que simulan más de cerca la unión e interacción de célula a célula natural. Aquí demostramos que el cultivo de tejidos en 3D es un modelo más efectivo para la entrega de una nanopartícula específica que lleva una carga útil de siRNA o miRNA. EDVTMnanocell patentado por EnGeneIC es un vehículo versátil capaz de empaquetar concentraciones terapéuticamente significativas de fármacos quimioterapéuticos y moléculas dirigidas molecularmente como siRNA y miRNA. Se puede recubrir con un diacuerpo biespecífico para una administración dirigida y una toxicidad muy reducida. En modelos de ratones con xenoinjertos y otros estudios en animales en los que las nanocélulas EDVTM administraron siARN o miARN, hemos demostrado una eficacia significativa del tratamiento, incluida la regresión tumoral y la eliminación de genes. Sin embargo, el cultivo de tejidos 2D no ha demostrado ser consistente en mostrar la muerte de células tumorales in vitro ni como predictor de eficacia en modelos in vivo posteriores. Hemos cultivado varias líneas de células tumorales diferentes como esferoides tridimensionales, incluidas algunas derivadas directamente de pacientes. Después de evaluar varios sistemas de modelos de esferoides para la administración y la absorción de nuestra nanocélula, descubrimos que la gota colgante de Biomatrix y el método de recubrimiento de gel fueron más útiles para mostrar una viabilidad celular reducida y una eliminación de genes en células tumorales tratadas con nanocélulas EDVTM que portan diferentes siARN o miARN y se dirigieron con anti-EGFR. Usando líneas de células estándar (ATCC), encontramos una penetración mejorada de nanocélulas que llevan siRNA contra la proteína PLK1 de la quinasa 1 tipo polo, en células de cáncer de colon HCT116 cultivadas en placas colgantes o matriz de gel como se muestra bajo microscopía confocal. La administración de siPLK1 dio como resultado una viabilidad celular reducida, detención mitótica y eliminación del ARNm de PLK1 en comparación con las nanocélulas que transportan ARNip sin sentido. Del mismo modo, demostramos que la entrega de partículas de un miR-34 mimético a los esferoides A549 del cáncer de pulmón dio como resultado una viabilidad celular reducida y la eliminación de uno de sus genes antiapoptóticos aguas abajo, Bcl 2. Además, hemos cultivado esferoides a partir de carcinomas de células suprarrenales derivados de pacientes, ACC (cortesía del profesor Stan Sidhu, Royal North Shore Hospital) en los que pudimos probar varias moléculas de siRNA y miRNA para determinar los efectos de destrucción celular. Hemos descubierto que los modelos de esferoides son una forma eficiente de predecir la eficacia de las nanocélulas EDVTM que transportan siRNA y miRNA, ya que imitan de cerca el crecimiento tumoral en modelos de xenoinjertos.Ítem Aislamientos de Staphylococcus aureus sensibles a meticilina relacionados genéticamente con el clon USA300, ¿origen de los aislamientos SARM de genotipo comunitario en Colombia?(Instituto Nacional de Salud, 2014) Marquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Gaines, Sebastián; Chavarro, Bibiana; Moreno-Castañeda, Jaime; Leal, Aura Lucía; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Castro Cardozo, Betsy Esperanza [0000-0003-1179-5382]; Márquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro [0000-0002-7188-6158]; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Introducción. USA300 es un linaje genético que se encuentra en aislamientos de Staphylococcus aureus sensibles (SASM) y resistentes a meticilina (SARM). Actualmente, en Colombia las infecciones por SARM en hospitales y en la comunidad son causadas principalmente por un clon con genotipo comunitario (SARM-GC) relacionado genéticamente con el clon USA300. El origen de esta variante es aún desconocido. Objetivo. Identificar y caracterizar aislamientos de S. aureus resistentes y sensibles a meticilina con el fin de aportar información para establecer un posible origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia. Materiales y métodos. Se realizó una caracterización de aislamientos SASM relacionados con el clon USA300 detectados a partir de un análisis de 184 aislamientos de S. aureus (90 SARM y 94 SASM) causantes de infecciones. La relación genética de los aislamientos se determinó por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), tipificación de secuencias multilocus (MLST) y tipificación del gen de la proteína A (spa). Resultados. De los 184 aislamientos, 27 (14,7 %) presentaron características moleculares y relación genética con el clon USA300, y de ellos, 18 fueron SARM y nueve fueron SASM. Todos los aislamientos SARM relacionados con este clon albergaban un casete estafilocócico cromosómico mec (SCCmec) IVc (3.1.2). En ningún aislamiento SASM se detectaron secuencias remanentes de SCCmec o una duplicación del sitio attB que evidenciaran la pérdida del casete. Conclusión. El origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia probablemente se encuentre en la diseminación de clones SASM relacionados con el clon USA300 que adquirieron el SCCmec IVc posteriormente.Ítem Characterization of macrolide resistance in Gram-positive cocci from Colombian hospitals: a countrywide surveillance(Elsevier, 2007) Reyes, Jinnethe; Hidalgo, Marylin; Diaz, Lorena; Rincon Núñez, Sandra; Moreno, Jaime Enrique; Vanegas, Natasha; Castañeda, Elizabeth; Arias, César A.; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]Ítem Colonización por Staphylococcus aureus resistente a la meticilina en una unidad de cuidados intensivos de adultos de un hospital colombiano: caracterización fenotípica y molecular con detección de un clon de circulación en la comunidad(Instituto Nacional de Salud, 2010) Olarte, Narda María; Valderrama, Ismael Alberto; Reyes, Karlo Roberto; Garzón, Martha Isabel; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Introducción. Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SARM) causa infecciones adquiridas en la comunidad y en el ámbito hospitalario. El ser portador de SARM se ha descrito como factor de riesgo para desarrollar infección clínica. Objetivo. Caracterizar la colonización por SARM en pacientes adultos de una unidad de cuidados intensivos colombiana, utilizando herramientas de biología molecular. Materiales y métodos. Entre febrero de 2007 y febrero de 2008 se tamizaron mediante hisopado nasofaríngeo, 705 pacientes al ingresar a la unidad de cuidados intensivos, de los cuales, 683 (96,9%) fueron seguidos semanalmente y al egreso de la unidad. Se determinó el perfil de sensibilidad de los aislamientos a 11 antibióticos por el método de dilución en agar; el 62,0% de los aislamientos de SARM fueron caracterizados genética y molecularmente. Resultados. Se tamizaron 705 pacientes al ingreso; 182 (25,8%) estaban colonizados por S. aureus, de los cuales, 51 (7,2%) eran resistentes a la meticilina. Se hizo el seguimiento durante la estancia en la unidad de cuidados intensivos a 683 pacientes, de los cuales, 62 (9,1%) fueron colonizados por SARM en dicha unidad. La prevalencia del clon chileno fue de 76,5% al ingreso y de 88,9% durante la estancia. El 16,0% de los pacientes colonizados desarrollaron algún tipo de infección por SARM. Se encontraron tres pacientes colonizados con SARM adquirido en la comunidad, los cuales fueron positivos para la leucocidina Panton-Valentine (Panton-Valentine leukocidin, PVL). Conclusiones. El 7,2% de los pacientes que ingresaron a la unidad de cuidados intensivos estaban colonizados con SARM. Éste es el primer reporte de colonización por aislamientos de SARM-ST8-SCCmec IVc adquirido en la comunidad y relacionado genéticamente con el clon pandémico USA300-0114 en Colombia.Ítem Community-associated Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Colombia(Centers for Disease Control and Prevention, 2006) Alvarez, Carlos; Barrientes, Oscar J.; Leal, Aura L.; Contreras, German A.; Barrero, Liliana; rincón, sandra; Diaz, Lorena; Vanegas, Natasha; Arias, Cesar AÍtem Cyto-immuno-therapy for Cancer: a pathway elicited by tumor-targeted, cytotoxic drug-packaged bacterially derived nanocells(CellPress, 2020) Sagnella, Sharon M.; Yang, Lu; Stubbs, Gemma E.; Boslem, Ebru; Martino-Echarri, Estefania; Smolarczyk, Katarzyna; Pattison, Stacey L.; Vanegas, Natasha; St Clair, Eva; Clarke, Stephen; Boockvar, John; MacDiarmid, Jennifer A.; Brahmbhatt, HimanshuÍtem Detection of a new community genotype methicillin-resistant staphylococcus aureus clone that Is unrelated to the USA300 clone and that causes pediatric infections in Colombia(American Society for Microbiology, 2013) Escobar-Pérez, Javier; Marquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Alvarez-Olmos, Martha I.; Leal, Aura Lucia; Castro, Betsy Esperanza; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Ítem Diseño de dos metodologías moleculares para la rápida identificación de aislamientos de Staphylococcus aureus resistente a meticilina asociados a la comunidad en Colombia(Instituto Nacional de Salud, 2012) Gómez, Ingrid Tatiana; Murillo, Martha Johanna; Chavarro, Bibiana; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Introducción. Los aislamientos de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad (SARM-AC), están aumentando la frecuencia de infecciones en personas sanas de la comunidad y en pacientes hospitalizados. En Colombia y en la región andina estos aislamientos tienen un componente genético relacionado con el clon pandémico USA300. Objetivo. Diseñar y estandarizar dos metodologías para la diferenciación rápida de aislamientos colombianos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad de los asociados al hospital (SARM-AH). Materiales y métodos. Se estandarizaron dos metodologías moleculares para la identificación de aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad. La primera se basa en la digestión diferencial con tres enzimas de restricción de los genes cinasa de carbamato (arcC) y cinasa de guanilato (gmk) para los tipos de secuencia 5 (ST5) y 8 (ST8), correspondientes a aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado al hospital y asociado a la comunidad, respectivamente. La segunda se basa en la amplificación por reacción en cadena de la polimerasa de cinco factores de virulencia que se encuentran de manera diferencial en estos aislamientos. Las dos metodologías fueron validadas en 237 aislamientos clínicos de S. aureus resistente a la meticilina. Resultados. Con la primera metodología se identificaron el 100 % y 93,2 % de los aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad y asociado al hospital, respectivamente. Con la segunda metodología se identificaron correctamente los dos tipos de aislamientos. Conclusiones. Estas dos metodologías son una buena alternativa en términos de ahorro en tiempo y dinero comparadas con otras técnicas, como la electroforesis en campo pulsado y la tipificación de secuencias multilocus para la rápida identificación de aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad en Colombia.Ítem Dissemination of multiple drug resistance genes by class 1 integrons in klebsiella pneumoniae isolates from four countries: a comparative study(American Society for Microbiology, 2011) Chowdhury, Piklu Roy; Ingold, Ana; Vanegas, Natasha; Martínez, Elena; Merlino, John; Merkier, Andrea Karina; Castro, Mercedes; González Rocha, Gerardo; Borthagaray, Graciela; Bello Toledo, Helia; Márquez, Carolina M.; Stokes, H. W.; Centrón, DanielaÍtem Emergence and spread of a new community-genotype methicillin-resistant Staphylococcus aureus clone in Colombia(Biomed Central, 2017) Reyes, Niradiz; Rebollo, Juan; Pinzón, Hernando; Tovar, Catalina; Moreno-Castañeda, Jaime; Corredor Rozo, Zayda Lorena; Moncada, Maria Victoria; Vanegas, Natasha; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Escobar-Pérez, Javier; Marquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Ítem Emerging and existing mechanisms co-operate in generating diverse β-lactam resistance phenotypes in geographically dispersed and genetically disparate Pseudomonas aeruginosa strains(Elsevier, 2013) Martinez, Elena; Escobar-Pérez, Javier; Márquez, Carolina; Vilacoba, Elisabet; Centrón, Daniela; Leal, Aura L.; Saavedra, Carlos; Saavedra, Sandra Y.; Tovar, Catalina; Vanegas, Natasha; Stokes, H.W.; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Ítem Establishment and multi drug resistance evolution of ST235 Pseudomonas aeruginosa strains in the intensive care unit of a Colombian hospital(Elsevier Masson, 2014) Martinez, Elena; Pérez, Javier Escobar; Buelvas, Francisco; Tovar, Catalina; Vanegas, Natasha; Stokes, H.W.Ítem First complete providencia rettgeri genome sequence, the NDM-1-producing clinical strain RB151(American Society for Microbiology, 2017) Marquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Leanne, Haggerty; Sim, Eby M.; Duarte, Carolina; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Beltran, Mauricio; Saavedra-Rojas, Sandra Yamile; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier; Petty, Nicola K.; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Ítem Genome plasticity favours double chromosomal Tn4401b-blaKPC-2 transposon insertion in the Pseudomonas aeruginosa ST235 clone(Biomed Central, 2019) Castellanos, Jaime; Abril Riaño, Deisy Julieth; Moncayo-Ortiz, José Ignacio; Corredor Rozo, Zayda Lorena; Reyes, Niradiz; Tovar, Catalina; Sánchez, Héctor Fabio; Guaca-González, Yina Marcela; Llanos-Uribe, Carmen Elisa; Olarte, Narda María; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Marquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Castellanos, Jaime [0000-0003-1596-8383]; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]; Abril Riaño, Deisy Julieth [0000-0002-6686-6283]Ítem Genomic epidemiology of NDM-1-Encoding Plasmids in latin american clinical isolates reveals insights into the evolution of multidrug resistance(Oxford University Press, 2017) Castellanos, Jaime; Haggerty, Leanne; Olarte, Narda María; Garza-Ramos, Ulises; Silva-Sanchez, Jesus; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Valderrama, Ismael Alberto; Charles, Ian G.; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier Antonio; Marquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Duarte, Carolina; Sim, Eby M.; Beltran, Mauricio; Moncada, Maria Victoria; Petty, Nicola K.; Castellanos, Jaime [0000-0003-1596-8383]Ítem Identification and “in silico” structural analysis of the glutamine-rich protein Qrp (YheA) in staphylococcus aureus(Bentham science publishers, 2019) Ospina Garcia, Katterine; Corredor Rozo, Zayda Lorena; Marquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Castellanos, Jaime; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier; Castellanos, Jaime [0000-0003-1596-8383]; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Ítem Neumonía necrosante por Staphylococcus aureus extrahospitalario resistente a la meticilina: reporte de dos casos en Colombia(Instituto Nacional de Salud, 2009) Gómez, Carlos Hernando; Perilla, Ana María; González, Camilo; Valderrama, Sandra Liliana; Vanegas, Natasha; Chavarro, Bibiana; Triana, Luis Carlos; Támara, José Roberto; Álvarez, Carlos ArturoEn los últimos años se ha informado la aparición de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina como causa de infecciones extrahospitalarias graves. En Colombia, en el 2006, se publicó el primer reporte de S. aureus como causa de infección de piel y tejidos blandos; en esta ocasión, presentamos el primer reporte de neumonía necrosante con etiología por S. aureus, en dos pacientes adultos que se caracterizaron por presentar progresión clínica rápida, estancia prolongada en cuidados intensivos y complicación de la neumonía con aparición de empiema. Ambos desarrollaron falla renal aguda, por lo que fueron manejados con linezolide, con adecuada respuesta clínica. Con la caracterización molecular de los aislamientos se confirmó la presencia del gen mecA que porta el casete SCCmec tipo IV y la producción de la toxina leucocidina Panton-Valentine.Ítem Nosocomial infections caused by community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus in Colombia(Mosby Inc., 2010) Alvarez, Carlos Arturo; Yomayusa Gonzalez, Nancy; Leal, Aura Lucia; Mendez-Alvarez, Sebastian; Moreno, Jaime; Ibañez, Milciades; Vanegas, NatashaÍtem Participation of the arcRACME protein in self-activation of the arc operon located in the arginine catabolism mobile element in pandemic clone USA300(Instituto Oswaldo Cruz, Ministério da Saúde, 2017) Corredor Rozo, Zayda Lorena; Márquez-Ortiz, Ricaurte Alejandro; Vanegas, Natasha; Escobar-Pérez, Javier; Castro Cardozo, Betsy Esperanza; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]Ítem Pediatric cases from Colombia caused by a Panton-Valentine Leukocidin-positive community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus ST8-SCCmecIVc clone(Wolters Kluwer, 2009) Alvarez-Olmos, Martha Isabel; Enríquez, Sandra P.; Pérez-Roth, Eduardo; Méndez-Alvarez, Sebastián; Escobar-Pérez, Javier; Vanegas, Natasha; Moreno, Jaime; Méndez-Alvarez, Sebastián; Escobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]