Plataformas de secuenciación de nueva generación y proteómica aplicadas a la virología vegetal: ¿cómo ha avanzado colombia?

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dc.contributor.authorMadroñero, Leidy Johana
dc.contributor.authorCorredor Rozo, Zayda Lorena
dc.contributor.authorEscobar-Pérez, Javier
dc.contributor.authorVelandia-Romero, Myriam Lucía
dc.contributor.orcidVelandia-Romero, Myriam Lucía [0000-0002-3340-7304]
dc.contributor.orcidEscobar-Pérez, Javier [0000-0002-0432-6978]
dc.date.accessioned2020-03-27T18:52:17Z
dc.date.available2020-03-27T18:52:17Z
dc.date.issued2019
dc.description.abstractLa producción y el comercio de cultivos es una de las actividades económicas más importantes para el país. Las enfermedades causadas por virus ocasionan graves pérdidas económicas en el sector, por lo tanto, la detección, diagnóstico y diseño de estrategias para su control y manejo es crucial. Las tecnologías de secuenciación masiva (NGS por sus siglas en ingles) y las ciencias Ómicas constituyen hoy, una herramienta para el descubrimiento de nuevos virus y para el estudio de la interacción entre los virus y su hospedero vegetal. Este conocimiento no solo permite el desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico, sino también permite el descubrimiento de componentes claves en la infección, los cuales podrían usarse para obtener plantas resistentes a los virus. En el mundo, el manejo de cultivos se está trabajando con ese enfoque. Por lo tanto, en esta revisión se presentan las diferentes aplicaciones de las tecnologías ómicas en la virología de plantas y el avance que ha alcanzado Colombia. Adicionalmente, se muestran los diferentes recursos y programas usados para el análisis bioinformático de datos ómicos. Debido a su costo cada vez más reducido, las tecnologías NGS son una excelente oportunidad para explorar fitopatologías en una gran diversidad de productos agrícolas y para mejorar su potencial comercial.spa
dc.description.abstractenglishCrop production and trade are two of the most economically important activities in Colombia, and viral diseases cause a high negative impact to agricultural sector. Therefore, the detection, diagnosis, control, and management of viral diseases are crucial. Currently, Next-Generation Sequencing (NGS) and ‘Omic’ technologies constitute a right-hand tool for the discovery of novel viruses and for studying virus-plant interactions. This knowledge allows the development of new viral diagnostic methods and the discovery of key components of infectious processes, which could be used to generate plants resistant to viral infections. Globally, crop sciences are advancing in this direction. In this review, advancements in ‘omic’ technologies and their different applications in plant virology in Colombia are discussed. In addition, bioinformatics pipelines and resources for omics data analyses are presented. Due to their decreasing prices, NGS technologies are becoming an affordable and promising means to explore many phytopathologies affecting a wide variety of Colombian crops so as to improve their trade potentialeng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.15446/abc.v24n3.79486
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.issn1900-1649
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/2185
dc.language.isoeng
dc.publisherUniversidad nacional de colombiaspa
dc.publisher.journalActa biologica colombianaspa
dc.relation.ispartofseriesActa biologica colombiana, 1900-164, Vol. 24, Nro. 3, 2019, p. 423-438spa
dc.relation.urihttps://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/79486
dc.rightsAttribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International*
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf200
dc.rights.creativecommons2019
dc.rights.localAcceso abiertospa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/*
dc.subjectInteracción planta-virusspa
dc.subjectvirología vegetalspa
dc.subjectGenómica de virusspa
dc.subject.decsCultivos agrícolasspa
dc.subject.decsEcosistemaspa
dc.subject.decsBiología Computacionalspa
dc.subject.keywordsPlant-virus interactionsspa
dc.subject.keywordsviral genomicsspa
dc.subject.keywordsPlant virologyspa
dc.titlePlataformas de secuenciación de nueva generación y proteómica aplicadas a la virología vegetal: ¿cómo ha avanzado colombia?spa
dc.title.translatedNext generation sequencing and proteomics in plant virology: How is Colombia doing?
dc.typearticlespa
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.localartículospa

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