Colonoscopy aspiration lavages for mucosal metataxonomic profiling of spondylarthritis-associated gastrointestinal tract alterations

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dc.contributor.authorMarquez Ortiz, Ricaurte A.
dc.contributor.authorLeon, Moises
dc.contributor.authorAbril, Deisy
dc.contributor.authorEscobar Perez, Javier
dc.contributor.authorFlorez Sarmiento, Cristian
dc.contributor.authorParra Izquierdo, Viviana
dc.contributor.authorChalem, Philippe
dc.contributor.authorRomero Sanchez, Consuelo
dc.contributor.orcidMarquez Ortiz, Ricaurte A. [0000-0002-7188-6158]
dc.contributor.orcidRomero Sanchez, Consuelo [0000-0002-6973-7639]
dc.date.accessioned2023-05-16T16:24:14Z
dc.date.available2023-05-16T16:24:14Z
dc.date.issued2023
dc.description.abstractEl estudio de la microbiota del tracto GI de pacientes con espondiloartritis (SpA) se ha centrado en el análisis de muestras de heces, que retratan principalmente la microbiota luminal. El objetivo de este estudio era determinar la contribución de la microbiota de la mucosa y la microbiota luminal a la disbiosis intestinal en la espondiloartritis, utilizando lavados por aspiración colonoscópica (LAC), una alternativa reciente para los estudios regionales del tracto gastrointestinal. Se analizaron 59 CAL (de colon sigmoide e íleon distal), y 41 muestras de heces, de 32 pacientes con SpA y 7 individuos sanos, utilizando perfiles metataxonómicos dirigidos al gen 16S rRNA. Se halló una alta prevalencia de manifestaciones del tracto gastrointestinal entre los pacientes con SpA (65,3%). El perfil metataxonómico confirmó que las muestras de CAL del tracto GI inferior (colon o íleon) presentaban un bacterioma distintivo e indiferenciado, distinto del encontrado en las muestras de heces o en el inicio del tracto GI (cavidad oral [OC]). Las muestras del tracto gastrointestinal inferior y las heces de los pacientes con EI mostraron un comportamiento similar al de la microbiota del grupo con EII, con una riqueza y diversidad microbianas reducidas, en comparación con los controles sanos. Curiosamente, se observó un aumento de los taxones proinflamatorios en los pacientes con EI, como la familia Enterobacteriaceae (principalmente en el íleon), Succinivibrio spp. y Prevotella stercorea. Por el contrario, los pacientes con EA presentaron una disminución significativa de los productores de AGCC Coprococcus catus y Eubacterium biforme. Nuestros datos apoyan el valor de las muestras de CAL para el estudio regional del tracto gastrointestinal y aportan información sobre los posibles "taxones perturbadores" implicados en los trastornos asociados al tracto gastrointestinal observados en los pacientes con SpA.spa
dc.description.abstractenglishhe study of the GI-tract microbiota of spondylarthritis (SpA) patients has focused on the analysis of feces samples, that picture mostly the luminal microbiota. The aim of this study was to determine the contribution of mucosal and luminal microbiome to the gut dysbiosis in SpA, using colonoscopy aspiration lavages (CAL), a recent alternative for regional studies of the GI-tract. We analyzed 59 CAL (from sigmoid colon and distal ileum), and 41 feces samples, from 32 SpA patients and 7 healthy individuals, using 16S rRNA gene-targeted metataxonomic profiling. It was found high prevalence of GI-tract manifestations among SpA patients (65.3%). Metataxonomic profiling, confirmed CAL samples from the lower GI tract (colon or ileum) presented a distinctive and undifferentiated bacteriome and separate from that found in feces’ samples or in the beginning of the GI tract (oral cavity (OC)). Lower GI-tract samples and feces of SpA patients exhibited similar behavior to the microbiota of IBD group with reduced microbial richness and diversity, comparing to the healthy controls. Interestingly, it was found increase in proinflammatory taxa in SpA patients, such as Enterobacteriaceae family (mostly in the ileum), Succinivibrio spp. and Prevotella stercorea. Conversely, SpA patients presented significant decrease in the SCFA producers Coprococcus catus and Eubacterium biforme. Our data support the value of CAL samples for the regional study of GI-tract and contribute with information of potential “disruptor taxa” involved in the GI-tract associated disorders observed in SpA patients.eng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1038/s41598-023-33597-y
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.issn2045-2322
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/10477
dc.language.isoeng
dc.publisherSpringer Naturespa
dc.publisher.journalScientific Reportsspa
dc.relation.ispartofseriesScientific Reports, 2045-2322, 13, 1. December. 2023, 7015spa
dc.relation.urihttps://www.nature.com/articles/s41598-023-33597-y
dc.rightsAtribución 4.0 Internacional*
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.localAcceso abiertospa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/*
dc.titleColonoscopy aspiration lavages for mucosal metataxonomic profiling of spondylarthritis-associated gastrointestinal tract alterationsspa
dc.title.translatedLavados por aspiración colonoscópica para el perfil metataxonómico mucoso de las alteraciones del tracto gastrointestinal asociadas a la espondiloartritisspa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.coarversionhttps://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/article
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.localArtículo de revista

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