Consolidación de un método de extracción de ADN de levaduras y caracterización molecular de microorganismos a ingresar en el Banco de Cepas y Genes IBUN

Resumen

Se realizó el mantenimiento de cepas criopreservadas tipo de la colección ATCC conservadas en el Banco de Cepas y Genes del Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia, además de la consolidación de un método de extracción de ADN para levaduras que no involucró el uso de enzimas específicas para polisacaridos fúnguicos, la evaluación de características microbiológicas de el producto comercial FlyBuster y el mantenimiento, descripción macroscópica y microscópica, además de la realización de PCR del gen 16s ARNr de 4 cepas bacterianas que se buscó ingresar a la colección. Por otro lado, al ADN de levaduras tambien se le realizó el protocolo de PCR para los ITS, sin embargo su caracterización no fue posible. De los resultados de la amplificación del gen 16s se encontró que dos de las cepas corresponden al género Bacillus, una a la especie Enterococcus lactis y la última a la especie Kosakonia cowanii, estas determinaciones finales realizadas con base en pruebas bioquímicas específicas seleccionadas a partir de la identificación apoyada con la herramienta BLAST del NCBI.

Descripción

Abstract

The maintenance of cryopreserved type strains from the ATCC collection conserved in the Bank of Strains and Genes of the Biotechnology Institute of the National University of Colombia was carried out, in addition to the consolidation of a DNA extraction method for yeasts that did not involve the use of specific enzymes for fungal polysaccharides, the evaluation of the microbiological characteristics of the FlyBuster commercial product and its maintenance, macroscopic and microscopic description, in addition to the PCR of the 16s rRNA gene of 4 bacterial strains that were sought to enter the collection. On the other hand, the PCR protocol for ITS was also performed on the yeast DNA, however its characterization was not possible. From the results of the amplification of the 16s gene, it was found that two of the strains correspond to the genus Bacillus, one to the species Enterococcus lactis and the last to the species Kosakonia cowanii, these final determinations made based on specific biochemical tests selected from the identification supported with the NCBI BLAST tool.

Palabras clave

Extracción ADN levaduras no enzimática, PCR ITS levadura, Caracterización molecular bacteriana, Taxonomía polifásica bacteriana, Identificación bacteriana 16s

Keywords

Non enzimatical yeast DNA extraction, Yeast ITS PCR, Bacterial molecular characterization, Bacterial polyphasic taxonomy, 16s bacterial identificaction

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