Transmission of Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae in US Hospitals

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dc.contributor.authorLuterbach, Courtney L.
dc.contributor.authorChen, Liang
dc.contributor.authorKomarow, Lauren
dc.contributor.authorOstrowsky, Belinda
dc.contributor.authorKaye, Keith S.
dc.contributor.authorHanson, Blake
dc.contributor.authorArias, Cesar A.
dc.contributor.authorDesai, Samit
dc.contributor.authorGallagher, Jason C.
dc.contributor.authorNovick, Elizabeth
dc.contributor.authorPagkalinawan, Stephen
dc.contributor.authorLautenbach, Ebbing
dc.contributor.authorWortmann, Glenn
dc.contributor.authorKalayjian, Robert C.
dc.contributor.authorEilertson, Brandon
dc.contributor.authorFarrell, John J.
dc.contributor.authorMcCarty, Todd
dc.contributor.authorHill, Carol
dc.contributor.authorFowler, Vance G.
dc.contributor.authorKreiswirth, Barry N.
dc.contributor.authorBonomo, Robert A.
dc.contributor.authorvan Duin, Davida
dc.date.accessioned2023-02-16T15:31:53Z
dc.date.available2023-02-16T15:31:53Z
dc.date.issued2023
dc.description.abstractAntecedentes. La Klebsiella pneumoniae resistente a los carbapenemes (CRKp) es el Enterobacterales resistente a los carbapenemes más prevalente en los Estados Unidos. Se evaluó la agrupación de CRKp en pacientes de hospitales estadounidenses. Métodos. De abril de 2016 a agosto de 2017, 350 pacientes con grupo clonal 258 CRKp se inscribieron en el Consortium on Resistance Against Carbapenems in Klebsiella and other Enterobacteriaceae, un estudio de cohortes prospectivo y multicéntrico. Se construyó un árbol de máxima verosimilitud utilizando RAxML. Los conglomerados estáticos compartían ≤21 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y un ancestro común más reciente. Los conglomerados dinámicos incorporaron la distancia SNP, el tiempo de cultivo y las tasas de acumulación y transmisión SNP utilizando el programa R TransCluster. Resultados. La mayoría de los pacientes ingresaron desde su domicilio (n=150, 43%) o desde centros de cuidados de larga duración (n=115, 33%). La orina (n=149, 43%) fue el lugar de aislamiento más común. En total, se identificaron 55 conglomerados estáticos y 47 dinámicos en 210 de 350 (60%) y 194 de 350 (55%) pacientes, respectivamente. Aproximadamente la mitad de los clusters estáticos eran idénticos a los dinámicos. Los conglomerados estáticos consistían en 33 (60%) conglomerados intrasistema y 22 (40%) conglomerados intersistema. Los conglomerados dinámicos estaban formados por 32 (68%) conglomerados intrasistema y 15 (32%) conglomerados intersistema y presentaban menos diferencias de SNP que los conglomerados estáticos (8 frente a 9; P=.045; intervalo de confianza [IC] del 95%: -4 a 0). Los conglomerados dinámicos intersistema contenían más pacientes que los conglomerados dinámicos intrasistema (mediana [intervalo intercuartílico], 4 [2, 7] frente a 2 [2, 2]; P=,007; IC del 95%: -3 a 0). Conclusiones. Se identificó una amplia transmisión intrasistémica e intersistémica de CRKp en pacientes estadounidenses hospitalizados. El uso de diferentes métodos para evaluar la similitud genética sólo dio lugar a diferencias menores en la interpretación.spa
dc.description.abstractenglishBackground. Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKp) is the most prevalent carbapenem-resistant Enterobacterales in the United States. We evaluated CRKp clustering in patients in US hospitals. Methods. From April 2016 to August 2017, 350 patients with clonal group 258 CRKp were enrolled in the Consortium on Resistance Against Carbapenems in Klebsiella and other Enterobacteriaceae, a prospective, multicenter, cohort study. A maximum likelihood tree was constructed using RAxML. Static clusters shared ≤21 single-nucleotide polymorphisms (SNP) and a most recent common ancestor. Dynamic clusters incorporated SNP distance, culture timing, and rates of SNP accumulation and transmission using the R program TransCluster. Results. Most patients were admitted from home (n=150, 43%) or long-term care facilities (n=115, 33%). Urine (n=149, 43%) was the most common isolation site. Overall, 55 static and 47 dynamics clusters were identified involving 210 of 350 (60%) and 194 of 350 (55%) patients, respectively. Approximately half of static clusters were identical to dynamic clusters. Static clusters consisted of 33 (60%) intrasystem and 22 (40%) intersystem clusters. Dynamic clusters consisted of 32 (68%) intrasystem and 15 (32%) intersystem clusters and had fewer SNP differences than static clusters (8 vs 9; P=.045; 95% confidence interval [CI]: −4 to 0). Dynamic intersystem clusters contained more patients than dynamic intrasystem clusters (median [interquartile range], 4 [2, 7] vs 2 [2, 2]; P=.007; 95% CI: −3 to 0). Conclusions. Widespread intrasystem and intersystem transmission of CRKp was identified in hospitalized US patients. Use of different methods for assessing genetic similarity resulted in only minor differences in interpretation.eng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.1093/cid/ciac791
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.issn1537-6591
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/9971
dc.language.isoeng
dc.publisherOxford University Pressspa
dc.publisherInfectious Diseases Society of Americaspa
dc.publisher.journalClinical Infectious Diseasesspa
dc.relation.ispartofseriesClinical Infectious Diseases, 1537-6591, 76, 2, 15 January 2023, 229–237spa
dc.relation.urihttps://academic.oup.com/cid/article/76/2/229/6731222
dc.rightsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional*
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsAcceso abierto
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/*
dc.subjectEnterobacterias resistentes a los carbapenemesspa
dc.subjectKlebsiella pneumoniaespa
dc.subjectGrupos de transmisiónspa
dc.subject.keywordsCarbapenem-resistant Enterobacteralesspa
dc.subject.keywordsKlebsiella pneumoniaespa
dc.subject.keywordsTransmission clustersspa
dc.titleTransmission of Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae in US Hospitalsspa
dc.title.translatedTransmisión de Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenemes en hospitales de EE.UU.spa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.coarversionhttps://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/article
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.localArtículo de revista

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