Molecular Analysis of Polymyxin Resistance among Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae in Colombia

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dc.contributor.authorde la Cadena, Elsa
dc.contributor.authorMojica, María Fernanda
dc.contributor.authorGarcía Betancur, Juan Carlos
dc.contributor.authorAppel, Tobías Manuel
dc.contributor.authorPorras, Jessica
dc.contributor.authorPallares, Christian José
dc.contributor.authorSolano Gutiérrez, Juan Sebastián
dc.contributor.authorRojas, Laura J.
dc.contributor.authorVillegas, María Virginia
dc.contributor.orcidde la Cadena, Elsa [0000-0003-0361-7893]
dc.contributor.orcidMojica, María Fernanda [0000-0002-1380-9824]
dc.contributor.orcidPorras, Jessica [0000-0002-0352-0146]
dc.contributor.orcidVillegas, María Virginia [0000-0003-1898-9067]
dc.date.accessioned2023-03-01T15:20:39Z
dc.date.available2023-03-01T15:20:39Z
dc.date.issued2021
dc.description.abstractLa resistencia a la polimixina en Klebsiella pneumoniae se ha atribuido a mutaciones en mgrB, phoPQ, pmrAB y crrAB y a la presencia de genes mediados por plásmidos mcr. En este trabajo se describen las características moleculares de 24 aislamientos de K. pneumoniae resistentes a polimixina y carbapenem recuperados en seis ciudades colombianas entre 2009 y 2019. Las concentraciones inhibitorias mínimas (CIM) a la polimixina se confirmaron por microdilución en caldo, y se realizó la secuenciación del genoma completo para determinar el tipo de secuencia, el resistoma y las mutaciones en los genes relacionados con la resistencia a la polimixina, así como la presencia de mcr. Los resultados mostraron una resistencia de alto nivel a la polimixina (CMI _ 4 _g/mL). blaKPC-3 estaba presente en la mayoría de los aislados (17/24; 71%), seguido de blaKPC-2 (6/24; 25%) y blaNDM-1 (1/24; 4%). La mayoría de los aislados pertenecían al CG258 (17/24; 71%) y presentaban sustituciones de aminoácidos en PmrB (22/24; 92%) y CrrB (15/24; 63%); las mutaciones en mgrB sólo se produjeron en cinco aislados (21%). No se identificaron mutaciones adicionales en pmrA, crrA y phoPQ ni en ninguno de los genes de resistencia mcr. En conclusión, se encontró diseminación clonal de aislamientos de K. pneumoniae resistentes a polimixina y carbapenemes en Colombia, principalmente asociados con CG258 y blaKPC-3. La vigilancia de esta bacteria multirresistente a fármacos se ha llevado a cabo en Colombia. La vigilancia de este clon multirresistente se justifica debido a las limitadas opciones terapéuticas para el tratamiento de las infecciones por K. pneumoniae resistente a carbapenemes.spa
dc.description.abstractenglishPolymyxin resistance in Klebsiella pneumoniae has been attributed to mutations in mgrB, phoPQ, pmrAB, and crrAB and to the presence of mcr plasmid-mediated genes. Herein, we describe the molecular characteristics of 24 polymyxin- and carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates recovered from six Colombian cities between 2009 and 2019. Minimum inhibitory concentrations (MICs) to polymyxin were confirmed by broth microdilution, and whole-genome sequencing was performed to determine sequence type, resistome, and mutations in the genes related to polymyxin resistance, as well the presence of mcr. The results showed high-level resistance to polymyxin (MICs _ 4 _g/mL). blaKPC-3 was present in the majority of isolates (17/24; 71%), followed by blaKPC-2 (6/24; 25%) and blaNDM-1 (1/24; 4%). Most isolates belonged to the CG258 (17/24; 71%) and presented amino acid substitutions in PmrB (22/24; 92%) and CrrB (15/24; 63%); mutations in mgrB occurred in only five isolates (21%). Additional mutations in pmrA, crrA, and phoPQ nor any of the mcr resistance genes were identified. In conclusion, we found clonal dissemination of polymyxin and carbapenemresistant K. pneumoniae isolates in Colombia, mainly associated with CG258 and blaKPC-3. Surveillance of this multidrug-resistant clone is warranted due to the limited therapeutic options for the treatment of carbapenem-resistant K. pneumoniae infections.eng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.3390/antibiotics10030284
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.issn2079-6382
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/10087
dc.language.isoeng
dc.publisherMDPIspa
dc.publisher.journalAntibioticsspa
dc.relation.ispartofseriesAntibiotics, 2079-6382, 10, 3, 2021, 284spa
dc.relation.urihttps://www.mdpi.com/2079-6382/10/3/284?type=check_update&version=2
dc.rightsAtribución 4.0 Internacional*
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightsAcceso abierto
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/*
dc.subjectKlebsiella pneumoniaespa
dc.subjectResistencia a múltiples fármacosspa
dc.subjectPolimixinasspa
dc.subjectSecuenciación del genoma completospa
dc.subject.keywordsKlebsiella pneumoniaespa
dc.subject.keywordsMultidrug resistancespa
dc.subject.keywordsPolymyxinsspa
dc.subject.keywordsWhole-genome sequencingspa
dc.titleMolecular Analysis of Polymyxin Resistance among Carbapenemase-Producing Klebsiella pneumoniae in Colombiaspa
dc.title.translatedAnálisis molecular de la resistencia a la polimixina en Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasas en Colombiaspa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/article
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.localArtículo de revista

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