Caracterización de los elementos transponibles NTEKPC en aislamientos clínicos colombianos de pseudomonas aeruginosa

Resumen

Pseudomonas aeruginosa es un microorganismo oportunista capaz de producir infecciones en pacientes de alto riesgo. La multiresistencia de este organismo ha aumentado debido a la presencia de genes para carbapenemasas de tipo serina como blaKPC, gen descubierto en Klebsiella pneumoniae y movilizado por transferencia horizontal a otras especies y géneros bacterianos; su diseminación se ha dado principalmente por el el transposón Tn4401, un elemento genético capaz de movilizar al gen blaKPC de una región del genoma a otra y que contribuye a su diseminación mediante transferencia horizontal de genes. Sin embargo, recientemente en K. pneumoniae se han encontrado algunos elementos genéticos no convencionales (NTEKPC) asociados a blaKPC. El objetivo de este trabajo consistió en caracterizar in silico un nuevo elemento NTEKPC encontrado en P. aeruginosa para contribuir con información que permita dilucidar diferentes mecanismos de diseminación de este determinante de resistencia, este nuevo elemento se clasificó como NTEKPC-IIf. Adicionalmente se buscó establecer la frecuencia de este tipo de elementos en un grupo de aislamientos encontrados en la ciudad de Bogotá y el municipio de Chía, Colombia. La caracterización molecular del Tn4401 (a-i) y los NTEKPC fue realizada mediante diferentes PCR que creando un método de detección y diferenciación del entorno genético de blaKPC basado en los elementos reportados hasta la fecha. Los resultados obtenidos demostraron que, a pesar de que el Tn4401 fue el elemento con mayor prevalencia, el NTEKPC-IIf se presentó en un número significativo de aislamientos (29.5%), y que este elemento es capaz de circular en diferentes linajes genéticos y en diferentes instituciones en la región.

Descripción

Abstract

P. aeruginosa is an opportunistic microorganism capable of causing infections in high-risk patients. The multiresistance of this organism has increased due to the presence of genes for carbapenemases such as blaKPC, a gene discovered in K. pneumoniae and mobilized by horizontal transfer to other bacterial species and genera; its dissemination has been mainly due to Tn4401. However, recently in K. pneumoniae some unconventional genetic elements (NTEKPC) associated with blaKPC have been found. The objective of this work was to characterize in silico a new NTEKPC element found in P. aeruginosa to contribute with information that allows to elucidate different dissemination mechanisms of this resistance determinant. This new element was classified as NTEKPC-IIf. Additionally, it was sought to establish the frequency of this type of elements in a group of isolates found in the city of Bogotá and the municipality of Chía, Colombia. The molecular characterization of the Tn4401 (a-i) and the NTEKPCs were carried out using different PCRs that created a method of detection and differentiation of the genetic environment of blaKPC based on the elements reported to date. The results obtained showed that, despite the fact that Tn4401 was the element with the highest prevalence, NTEKPC-IIf was present in a significant number of isolates (29.5%), and that this element is capable of circulating in different genetic lineages and in different institutions in the region.

Palabras clave

Pseudomonas aeruginosa, NTEKPC, NTEKPC-IIf, Elementos geneticos moviles, Tn4401, BlaKPC, Transferencia horizontal de genes

Keywords

NTEKPC, NTEKPC-IIf, Tn4401, Pseudomonas aeruginosa, BlaKPC, Mobile genetic elements, Horizontal gene transfer

Temáticas

Citación

Colecciones