Caracterización epidemiológica y molecular de protozoos intestinales (Blastocystis, Giardia, Cryptosporidium y complejo Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii), en población infantil y canina de la comuna ocho de Popayán (Cauca, Colombia)

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dc.contributor.advisorRamírez González, Juan David
dc.contributor.advisorReinel Vásquez, Luis
dc.contributor.authorVillamizar Soler, Sandra Ximena
dc.coverage.spatialPopayán (Cauca, Colombia)spa
dc.date.accessioned2022-08-04T23:17:08Z
dc.date.available2022-08-04T23:17:08Z
dc.date.issued2018
dc.description.abstractAntecedentes: Las infecciones parasitarias, particularmente las causadas por protozoos, representan un considerable problema de salud pública en Colombia, afectando a población infantil debido principalmente a factores inmunológicos, ambientales y socioeconómicos. Entre los protozoarios, Blastocystis spp., Giardia duodenalis (sinónimo de G. intestinalis y G. lamblia), Cryptosporidium spp. y miembros del complejo Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii son las causas etiológicas más comunes de las infecciones intestinales parasitarias. Metodología: Un estudio descriptivo de corte trasversal fue llevado a cabo en una población infantil en edad escolar de 12 y 54 meses que asisten al hogar infantil pequeñines de la comuna ocho de Popayán, Cauca (Sur oeste Colombia). Un total de 266 muestras fecales fueron recolectadas (258 de niños y 8 de mascotas). Blastocystis spp., Giardia duodenalis, Cryptosporidium spp, y miembros del complejo Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii fueron identificados por microscopia y PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) y PCR convencional, la concordancia de qPCR y microscopía se evaluó utilizando el índice Kappa. A partir de las muestras positivas por PCR en tiempo real (qPCR) se realizó caracterización molecular llevando a cabo la amplificación y secuenciación de marcadores moleculares para la identificación de subtipos de Blastocystis spp. (18S); ensamblajes de Giardia (TPI y GDH) y especies/subtipos de Cryptosporidium spp. (18S y GP60). De acuerdo con los resultados, mediante análisis bivariados, se determinó la existencia de asociación entre el parasitismo intestinal y las variables sociodemográficas. Resultados: Un total de 258 muestras fecales de niños se analizaron por microscopia y 255 por PCR en tiempo real (qPCR). Obtuvimos una frecuencia de infección de Blastocystis spp. de 25,19% (microscopia) y 39,22% (qPCR); para Giardia duodenalis 8,14% (microscopia) y 10,59% (qPCR); Cryptosporidium spp. fue identificado únicamente por qPCR 9,8% y miembros del complejo Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii 0,78% (microscopia) y 0,39% (PCR convencional). La concordancia entre microscopia y qPCR fue muy baja. Con relación, a los subtipos de Blastocystis spp. se identificaron los ST1 (alelos 4, 8, 80), ST2 (alelos 11, 12, 15), ST3 (alelos 31, 34, 36, 38,57, 151) y ST4 (alelos 42 y 91). Para Giardia duodenalis se identificaron los ensamblajes AII, BIII, BIV y D; se encontraron las especies C.parvum subtipo IIa y C. hominis subtipo IbA9G3R2; el único miembro del complejo Entamoeba identificado corresponde a E. histolytica. Por otra parte, en las heces de las mascotas se identificó Blastocystis spp. ST1 (alelo 4), Giardia duodenalis ensamblaje BIII y C.parvum subtipo IIa. No se encontró asociación estadísticamente significativa entre la infección parasitaria y las variables sociodemográficas evaluadas. Conclusión: Este estudio revela la prevalencia de Blastocystis spp., Giardia duodenalis, Cryptosporidium spp. y miembros del complejo Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii y la distribución de los subtipos/ensamblajes/especies en la población infantil de Popayán; la presencia de estos protozoos en animales domésticos podría estar implicada en la transmisión.spa
dc.description.abstractenglishBackground: Parasitic infections, particularly those caused by protozoa, represent a considerable public health problem in Colombia and disproportionately affect the infant population owing to immunological, environmental and socioeconomic factors. Blastocystis spp., Giardia duodenalis (also known as Giardia intestinalis and Giardia lamblia), Cryptosporidium spp. and members of the Entamoeba complex (Entamoeba histolytica, Entamoeba dispar and Entamoeba moshkovskii) are the most common etiological causes of intestinal parasitic infections. Methods: We carried out a descriptive cross-sectional study in school-age children (age 12–54 months) attending the Pequeñines daycare in commune eight of Popayán, Cauca (Southwest Colombia). A total of 266 fecal samples were collected (258 from children and eight from pets). Blastocystis spp., G. duodenalis, Cryptosporidium spp. and members of the Entamoeba complex were identified by microscopy, quantitative real-time PCR (qPCR) and conventional PCR. The concordance of qPCR and microscopy was assessed using the Kappa index. For samples that were positive by qPCR, molecular characterization was conducted using PCR amplification and sequencing of molecular markers specific to Blastocystis subtypes (18S), G. duodenalis assemblages (tpi and gdh) and Cryptosporidium species/subtypes (18S and GP60). Potential associations between intestinal parasitism and sociodemographic factors were examined using bivariate analyses. Results: A total of 258 fecal samples from children were analyzed by microscopy and 255 samples were analyzed by qPCR. The prevalence of Blastocystis spp. was between 25.19% (microscopy) and 39.22% (qPCR), that of G. duodenalis was between 8.14% (microscopy) and 10.59% (qPCR), that of Cryptosporidium spp. was estimated at 9.8% (qPCR), and that of Entamoeba complex members was between 0.39% (conventional PCR) and 0.78% (microscopy). The concordance between microscopy and qPCR prevalence estimates was very low. Blastocystis ST1 (alleles 4, 8, and 80), ST2 (alleles 11, 12, and 15), ST3 (alleles 31, 34, 36, 38,57, and 151), and ST4 (alleles 42 and 91), G. duodenalis assemblages AII, BIII, BIV and D, C. parvum subtype IIa and C. hominis subtype IbA9G3R2 were identified. The only identified member of the Entamoeba complex corresponded to E. histolytica. Blastocystis ST1 (allele 4), G. duodenalis assemblage BIII and C. parvum subtype IIa were identified in the feces of pets. No statistically significant association was identified between parasitic infection and any sociodemographic variable. Conclusion: This study revealed the prevalence of Blastocystis spp., G. duodenalis, Cryptosporidium spp. and members of the Entamoeba complex as well as the distribution of subtypes/assemblages/species of these parasites among children in Popayán. The presence of some of these protozoa in domestic animals may be involved in their transmission.eng
dc.description.degreelevelMaestríaspa
dc.description.degreenameMagíster en Ciencias Básicas Biomédicasspa
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/8622
dc.language.isospa
dc.publisher.facultyFacultad de Medicinaspa
dc.publisher.grantorUniversidad El Bosquespa
dc.publisher.programMaestría en Ciencias Básicas Biomédicasspa
dc.rightsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional*
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.localAcceso abiertospa
dc.subjectBlastocystis sppspa
dc.subjectGiardia sppspa
dc.subjectCryptosporidium sppspa
dc.subjectComplejo Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskiispa
dc.subjectTransmisión zoonóticaspa
dc.subject.keywordsBlastocystisspa
dc.subject.keywordsGiardiaspa
dc.subject.keywordsCryptosporidiumspa
dc.subject.keywordsEntamoeba histolytica/dispar/moshkovskii complexspa
dc.subject.keywordsZoonotic diseasespa
dc.subject.nlmW 50
dc.titleCaracterización epidemiológica y molecular de protozoos intestinales (Blastocystis, Giardia, Cryptosporidium y complejo Entamoeba histolytica/dispar/moshkovskii), en población infantil y canina de la comuna ocho de Popayán (Cauca, Colombia)spa
dc.title.translatedMolecular and descriptive epidemiology of intestinal protozoan parasites of children and their pets in Cauca, Colombia: A cross-sectional studyspa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_bdcc
dc.type.coarversionhttps://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Maestríaspa

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