Emergence and Transmission of Daptomycin and Vancomycin-Resistant Enterococci Between Patients and Hospital Rooms
Cargando...
Fecha
2021
Título de la revista
Publicado en
Clinical infectious diseases, 1537-6591, Vol 73, Num 12, 2021, pag 2306-2313
Publicado por
Oxford University Press
Infectious Diseases Society of America
Infectious Diseases Society of America
URL de la fuente
ISSN de la revista
Título del volumen
Resumen
Antecedentes Los enterococos resistentes a la vancomicina (ERV) son una causa importante de morbilidad y mortalidad en pacientes inmunodeprimidos. El seguimiento de la diseminación de cepas de ERV es crucial para comprender la dinámica de aparición y propagación de ERV en el medio hospitalario. Métodos Se realizaron secuenciación del genoma completo (WGS) y análisis filogenéticos para identificar las cepas de ERV dominantes y las posibles redes de transmisión entre 35 pacientes con hisopos rectales positivos para ERV y sus habitaciones (habitaciones principales y baños) en las plantas de leucemia (LKM) y de trasplante de células hematopoyéticas (HCT). También se determinaron los tipos de secuencia (ST), los genes de resistencia a fármacos y los resultados de los pacientes. Resultados Se aislaron en ambas plantas un total de 89 cepas de ERV agrupadas en 10 tipos de secuencia diferentes, de los cuales se describieron nuevos tipos de secuencia (ST736, ST494, ST772 y ST1516). Se observaron cepas muy relacionadas genéticamente que se transmitían entre habitaciones, plantas y periodos de tiempo en un periodo medio de 39 días (con un rango de 3 a 90 días). De 5 casos de bacteriemia por ERV, 3 cepas carecían del operón pili fms14-17-13 (ST203) y las 2 restantes eran resistentes a la daptomicina (DAP; ST736, ST664). De los 10 pacientes que albergaban cepas resistentes a la DAP, solo 2 habían estado expuestos a la DAP en los 4 meses anteriores a la recuperación de la cepa. Conclusiones Nuestras comparaciones de cepas de ERV derivadas del entorno y de pacientes inmunodeprimidos confirmaron la transferencia horizontal de linajes genéticos altamente relacionados de cepas de ERV multirresistentes (en particular a la DAP) entre pacientes sometidos a TCH y LKM y el entorno de su habitación. La aplicación de la WGS puede ser útil para distinguir reservorios de ERV en los que dirigir las intervenciones para prevenir y controlar la propagación de organismos altamente resistentes.
Descripción
Abstract
Background Vancomycin-resistant enterococci (VRE) are a major cause of morbidity and mortality in immunocompromised patients. Tracking the dissemination of VRE strains is crucial to understand the dynamics of emergence and spread of VRE in the hospital setting. Methods Whole genome sequencing (WGS) and phylogenetic analyses were performed to identify dominant VRE strains and potential transmission networks between 35 patients with VRE-positive rectal swabs and their rooms (main rooms and bathrooms) on the leukemia (LKM) and the hematopoietic cell transplant (HCT) floors. Sequence types (STs), drug resistance genes, and patients’ outcomes were also determined. Results A total of 89 VRE strains grouped into 10 different STs, of which newly described STs were isolated from both floors (ST736, ST494, ST772, and ST1516). We observed highly genetically related strains transmitted between rooms, floors, and time periods in an average period of 39 days (ranging from 3 to 90 days). Of 5 VRE bacteremia events, 3 strains were lacking the pili operon fms14–17–13 (ST203) and the remaining 2 were resistant to daptomycin (DAP; ST736, ST664). Of 10 patients harboring DAP-resistant strains, only 2 were exposed to DAP within 4 months before strain recovery. Conclusions Our comparisons of VRE strains derived from the environment and immunocompromised patients confirmed horizontal transfer of highly related genetic lineages of multidrug-resistant (particularly to DAP) VRE strains between HCT and LKM patients and their room environment. Implementing WGS can be useful in distinguishing VRE reservoirs where interventions can be targeted to prevent and control the spread of highly resistant organisms.
Palabras clave
Daptomicina (DAP), Inmunocomprometidos, Transmisión, Enterococos resistentes a la vancomicina (ERV), Secuenciación del genoma completo
Keywords
Daptomycin (DAP), Immunocompromised, Transmission, Vancomycin-resistant enterococci (VRE), Whole genome sequencing