Síntesis de un nuevo Inhibidor No Nucleósido de la Transcriptasa Inversa (ITI-NN) para el tratamiento de VIH-1 diseñado a través de acoplamiento molecular y un modelo QSAR

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dc.contributor.advisorGuevara Pulido, James
dc.contributor.authorMosos Campos, Néstor Andrés
dc.contributor.authorCamargo Roldán, Tania Camila
dc.contributor.authorMontoya Forero, Ophir Sophia
dc.contributor.orcidMosos Campos, Néstor Andrés [0009-0006-0755-0082]spa
dc.contributor.orcidCamargo Roldán, Tania Camila [0009-0004-1351-0242]spa
dc.contributor.orcidMontoya Forero, Ophir Sophia [0009-0009-1719-7077]spa
dc.date.accessioned2023-12-01T16:28:42Z
dc.date.available2023-12-01T16:28:42Z
dc.date.issued2023
dc.description.abstractEn este trabajo se buscó diseñar y sintetizar análogos de inhibidores de la transcriptasa inversa no nucleósidos (ITI-NN), un grupo de fármacos comerciales ampliamente empleados en el tratamiento del VIH/SIDA, que pueda tener mejores propiedades a comparación de los fármacos comerciales. Se empezó buscando análogos a los ITI-NN comerciales con valores de concentración inhibitoria 50 (IC50) experimentales reportados en la literatura. Una vez recolectadas las moléculas, se decidió trabajar con moléculas derivadas de la nevirapina, doravirina y rilpivirina y etravirina para realizar un cribado virtual basado en estructura para determinar energías de afinidad al blanco molecular empelando softwares de computadora. Simultáneamente, se llevó a cabo un cribado virtual basado en ligando por aparte de los 3 núcleos a trabajar, a partir de un modelo QSAR basado en la red neuronal del grupo de investigación INQA para poder predecir valores de IC50. Se encontró que el mejor modelo predictivo fue el de la nevirapina a partir de 6 descriptores, con un R2 ajustado de 0,755 y con el cumplimiento de demás parámetros de validación. Teniendo esto en cuenta y las ventajas en cuanto a síntesis otorgadas por la nevirapina, se eligió este núcleo farmacofórico para realizar nuevos análogos. Se le realizaron 65 cambios estructurales de diversos tipos para encontrar un análogo con mejorías en términos de energía de afinidad, IC50, toxicidad predicha y facilidad de síntesis, obteniendo así el análogo nevj3e1. Para llegar a este análogo, se realizó una sustitución electrofílica aromática al anillo de la nevirapina por el cloruro de bencenosulfonilo, catalizada por FeCl3 o AlCl3, en THF a diversas condiciones. De múltiples intentos, se destacan 3 intentos relevantes cuyos productos de reacción se caracterizaron por IR y RMN 1H-13C, corroborando la transformación de los productos de reacción. La formación de un crudo de reacción espeso difícil de manipular en reacciones catalizadas por FeCl3, la obtención de muy bajos rendimientos y la dificultad de purificar los productos, fueron los desafíos más grandes que se presentaron. Debido a que no se obtuvo un producto de reacción con alta pureza, imposibilitó la realización de pruebas de viabilidad celular en líneas celulares L929.spa
dc.description.abstractenglishIn this work we sought to design and synthesize analogues of non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NN-RTI), a group of commercial drugs widely used in the treatment of HIV/AIDS, which exhibit better properties compared to commercial drugs. A search for analogues of commercial NN-RTIs with experimental inhibitory concentration 50 (IC50) values ​​reported in the literature was performed. Once the molecules were collected, it was decided to work with molecules derived from nevirapine, doravirine and rilpivirine, and etravirine to perform a structure-based virtual screening to determine affinity energies to the molecular target using computer software. Simultaneously, a ligand-based virtual screening was carried out for each of the 3 groups of molecules, using a QSAR model based on the neural network of the INQA research group to predict IC50 values. It was found that the best predictive model was that of nevirapine, which employed 6 descriptors, with an adjusted R2 of 0.755 and in compliance with other validation parameters. Taking this into account and the advantages in terms of synthesis provided by nevirapine, this pharmacophoric nucleus was chosen to design new analogues. 65 structural changes of various types were made to find an analogue with an improved affinity score, IC50, predicted toxicity and synthesis process, thus obtaining the nevj3e1 analogue. In order to obtain this analogue, an electrophilic aromatic substitution of the nevirapine ring with benzenesulfonyl chloride, catalyzed by FeCl3 or AlCl3, was carried out in THF at various conditions. Out of multiple attempts, 3 relevant attempts stand out whose reaction products were characterized by IR spectroscopy and 1H-13C NMR, corroborating the transformation of the reaction products. The formation of a thick reaction crude tar, which was difficult to handle in reactions catalyzed by FeCl3, a very low reaction yield and the difficulty of purifying the products were the biggest challenges that arose. Because a reaction product with high purity was not obtained, it made it impossible to perform cell viability tests on L929 cell lines.spa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreelevelQuímico Farmacéuticospa
dc.description.sponsorshipUniversidad El Bosquespa
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad El Bosquespa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/11574
dc.language.isospaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Cienciasspa
dc.publisher.grantorUniversidad El Bosquespa
dc.publisher.programQuímica Farmacéuticaspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccess
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_14cb
dc.rights.localAcceso cerradospa
dc.subjectVIHspa
dc.subjectTranscriptasa inversaspa
dc.subjectAcoplamiento molecularspa
dc.subjectQSARspa
dc.subjectSíntesis orgánicaspa
dc.subject.ddc615.19
dc.subject.keywordsHIVspa
dc.subject.keywordsReverse transcriptasespa
dc.subject.keywordsMolecular dockingspa
dc.subject.keywordsQSARspa
dc.subject.keywordsOrganic synthesisspa
dc.titleSíntesis de un nuevo Inhibidor No Nucleósido de la Transcriptasa Inversa (ITI-NN) para el tratamiento de VIH-1 diseñado a través de acoplamiento molecular y un modelo QSARspa
dc.title.translatedSynthesis of a novel Non-Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitor (NN-RTI) for the treatment of HIV-1 designed through molecular docking and a QSAR modelspa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversionhttps://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado

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