Impacto de los antibióticos en el microbioma bacteriano de niños que asisten al servicio de urgencias y hospitalización de la clínica Cobos Medical Center

Resumen

El microbioma del ser humano tiene gran influencia en el desarrollo del sistema inmune; por lo que es de gran importancia estudiar el impacto que tienen los antibióticos orales o parenterales administrados en el microbioma de los lactantes. Hay un cambio después de la administración de estos antibióticos; ya que hay muerte del microbioma benéfico y proliferación de familias patógenas posterior a la exposición de un antibiótico, esta proliferación de microbioma patógeno puede estar relacionada con la adquisición a largo plazo de comorbilidades. En este estudio se realizará un muestreo secuencial por conveniencia reclutando 40 pacientes entre los 6 y los 24 meses de edad, que reciben antibióticos orales y parenterales por alguna causa patológica en el servicio de urgencias pediátricas Los Cobos Medical Center. Para poder establecer los cambios en el microbioma, medidos a través del número de especies encontradas (reportadas como diversidad-α y diversidad- β) y la proporción de las diferentes especies (reportado como porcentajes de cada especie) entre él momento previo al inicio de terapia antimicrobiana y los 7 y 60 días posteriores al inicio de la misma, será utilizado como estadístico de prueba la razón de varianzas mediante análisis de la varianza (ANOVA) de medidas repetidas, esto debido a la dependencia entre las muestras analizadas. Esta identificación de microrganismos en muestras biológicas por medio de técnicas secuenciación, se utilizara posteriormente para establecer similitudes y diferencias de este microbioma con respecto a otras poblaciones según lo reportado en bases de datos para poder asociar la microbiota encontrada con futuras comorbilidades.

Descripción

Abstract

The microbiome of the human being has great influence on the development of the immune system; therefore, it is very important to study the impact that oral or parenteral antibiotics have on the microbiome of infants. There is a change after the administration of these antibiotics; since there is death of the beneficial microbiome and proliferation of pathogenic families after exposure of an antibiotic, this proliferation of pathogenic microbiome may be related to the long-term acquisition of comorbidities. In this study, a sequential sampling will be carried out for convenience, recruiting 40 patients between 6 and 24 months of age, who will receive oral and parenteral antibiotics for some pathological cause in the Los Cobos Medical Center pediatric emergency department. In order to establish the changes in the microbiome, measured through the number of species found (reported as diversity-α and diversity-β) and the proportion of the different species (reported as percentages of each species) between the moment before the start of Antimicrobial therapy and 7 and 60 days after the start of it, the ratio of variances by analysis of variance (ANOVA) of repeated measures will be used as test statistics, due to the dependence between the samples analyzed. This identification of microorganisms in biological samples by means of technical sequencing is subsequently used to establish similarities and differences of this microbiome with respect to other populations as reported in databases to be able to associate the microbiota found with future comorbidities.

Palabras clave

Microbioma, Secuenciación, ANOVA, Comorbilidades

Keywords

Microbiome, Sequencing, Comorbidities, ANOVA

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