Exploring Blastocystis genetic diversity in rural schoolchildren from Colombia using next-generation amplicon sequencing reveals significant associations between contact with animals and infection risk
Fecha
2023
Título de la revista
Publicado en
Parasitology Research, 1432-1955, 2023
Publicado por
Springer Nature
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Resumen
Blastocystis es un protista intestinal común con una distribución mundial en humanos y muchos otros animales. Sin embargo, el estatus de Blastocystis como patógeno, los factores de riesgo asociados a su transmisión y su potencial zoonótico siguen sin estar bien definidos. Aquí, exploramos la diversidad del subtipo (ST) y los factores de riesgo potenciales para la infección por Blastocystis en 98 niños de Apulo, Colombia. Las muestras fueron cribadas para Blastocystis mediante PCR, y la identificación de ST se realizó mediante secuenciación de amplicones de próxima generación (NGS). Las asociaciones entre la presencia de Blastocystis y ST individuales y las variables sociodemográficas se evaluaron mediante análisis de regresión logística. Setenta y una muestras (72,4%) fueron positivas para Blastocystis, y la NGS reveló la presencia de cinco ST (ST1-ST5). ST1, ST2 y ST3 fueron comunes y se observaron en proporciones casi iguales (~ 40%), mientras que las muestras con ST4 (1,4%) y ST5 (5,6%) fueron comparativamente raras. También fue frecuente la presencia de ST mixtos en la misma muestra (28,2%). Las comparaciones entre niños de un mismo hogar revelaron que los perfiles de ST compartidos eran frecuentes, pero también se observó diversidad dentro de las unidades familiares. Los análisis de regresión logística arrojaron asociaciones significativas entre la presencia de Blastocystis, subtipos individuales o subtipos mixtos para varias variables. Curiosamente, la presencia de animales fue una de las asociaciones significativas más comunes. En conjunto, estos datos representan un importante paso adelante en la comprensión tanto de las rutas potenciales como de los factores de riesgo que pueden influir en la transmisión de Blastocystis, y serán útiles para dar forma a futuros estudios que traten de aclarar las relaciones entre los ST, la patogenicidad y la transmisión zoonótica.
Descripción
Abstract
Blastocystis is a common intestinal protist with a global distribution in humans and many other animals. Yet, the status of Blastocystis as a pathogen, the risk factors associated with its transmission, and its zoonotic potential remain ill-defined. Here, we explored subtype (ST) diversity and potential risk factors for Blastocystis infection in 98 children from Apulo, Colombia. Samples were screened for Blastocystis via PCR, and ST identification was performed through next-generation amplicon sequencing (NGS). Associations between the presence of Blastocystis and individual STs and sociodemographic variables were assessed via logistic regression analyses. Seventy-one samples (72.4%) were Blastocystis-positive, and NGS revealed the presence of five STs (ST1-ST5). ST1, ST2, and ST3 were common and observed in nearly equal proportions (~ 40%), while samples with ST4 (1.4%) and ST5 (5.6%) were comparatively rare. The presence of mixed STs in the same sample was also common (28.2%). Comparisons among children within the same household identified that shared ST profiles were common, but diversity within family units was also observed. Logistic regression analyses returned significant associations between the presence of Blastocystis, individual subtypes, or mixed subtypes for several variables. Intriguingly, the presence of animals was one of the most common significant associations. Taken together, these data represent an important step forward in understanding both the potential routes and risk factors that may influence Blastocystis transmission and will be useful in shaping future studies which seek to clarify the relationships between STs, pathogenicity, and zoonotic transmission.
Palabras clave
Blastocystis, Colombia, Subtipos, Secuenciación de amplicones de nueva generación, Factores de riesgo, Transmisión zoonótica
Keywords
Blastocystis, Colombia, Subtypes, Next-generation amplicon sequencing, Risk factors, Zoonotic transmission