Human respiratory syncytial virus and metapneumovirus in patients with acute respiratory infection in Colombia, 2000–2011

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dc.contributor.authorBarbosa Ramirez, Juliana
dc.contributor.authorPulido Dominguez, Paola
dc.contributor.authorRey Benito, Gloria
dc.contributor.authorMendez Rico, Jairo
dc.contributor.authorCastellanos, Jaime
dc.contributor.authorPáez Martinez, Andrés
dc.contributor.orcidCastellanos, Jaime [0000-0003-1596-8383]
dc.date.accessioned2020-05-14T17:44:23Z
dc.date.available2020-05-14T17:44:23Z
dc.date.issued2014
dc.description.abstractOBJETIVO: Describir la epidemiología y tendencias estacionales del virus sincitial respiratorio (VSR) y metapneumovirus humano (MPVh) en Colombia durante el período 2000 - 2011. MÉTODOS: Se recolectaron aspirados nasofaríngeos o hisopados faríngeos de 14 870 pacientes con infección respiratoria aguda. Se analizaron dos subgrupos por técnicas de biología molecular. El primero estuvo compuesto por 264 muestras positivas para el VSR por inmunofluorescencia indirecta (IFI), y el segundo estuvo compuesto por 264 muestras negativas para el VSR por IFI. La técnica utilizada para la detección del VSR y el MPVh en ambos subgrupos fue la transcripción inversa asociada a la reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR). RESULTADOS: 2 799 muestras (18,8%) contenían algún virus respiratorio. Se detectó VSR por IFI en 1 333 muestras (8,9%), e igualmente fue detectado por RT-PCR en 192 muestras en el subgrupo de muestras positivas para el VSR por IFI y en 25 muestras en el subgrupo de muestras negativas para el VSR por IFI. Se detectó MPVh en 8 muestras en el subgrupo de muestras positivas para el VSR por IFI, y en 11 muestras en el subgrupo de muestras negativas para el VSR por IFI. De las infecciones causadas por el VSR, el subtipo A fue dominante en períodos bianuales; en contraste, el subtipo B fue dominante en períodos anuales. El 85,3% de las infecciones por el VSR y 74% de las infecciones por el MPVh ocurrieron en niños menores de 5 años de edad. Las infecciones causadas por el VSR y el MPVh se asociaron con las estaciones de lluvia. Se encontró coinfección con VSR A y VSR B en 2 pacientes, y coinfección con VSR y MPVh en 5 pacientes. CONCLUSIONES: Esta investigación es la primera en estudiar la epidemiología de las infecciones respiratorias agudas en Colombia, con énfasis en las causadas por el VSR y el MPVh. Las muestras estudiadas fueron recolectadas durante un período de 12 años y representan todos los grupos etarios de ambos sexos.(AU)spa
dc.description.abstractenglishOBJECTIVE: To describe the epidemiology of respiratory syncytial virus (RSV) and human metapneumovirus (hMPV) in Colombia from 2000 - 2011, including seasonal trends. METHODS: Nasopharyngeal aspirates and/or throat swabs from 14 870 patients with acute respiratory infections (ARI) were studied. Two subgroups were analyzed using molecular biology techniques. The first consisted of 264 RSV indirect fluorescence assay (IFA)-positive samples, the second of 264 RSV IFA-negative samples. RSV and hMPV were detected using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). RESULTS: 2 799 samples (18.8%) contained a respiratory virus. RSV was detected by IFA in 1 333 samples (8.9%). RSV was detected by RT-PCR in 192 samples from the RSV IFA-positive subgroup and in 25 samples from the RSV IFA-negative subgroup. hMPV was detected in eight samples from the RSV IFA-positive subgroup and in 11 samples from the RSV IFA-negative subgroup. Among the RSV infections, subtype A was dominant in two-year intervals, subtype B was dominant in one-year intervals. 85.3% of RSV and 74% of hMPV infections occurred in children younger than 5 years old. RSV and hMPV infections were associated with rainy seasons. Co-infection with RSV A and RSV B was detected in two patients. Five cases of co-infection with RSV and hMPV were detected. CONCLUSIONS: This report is the first to examine the epidemiology of ARIs in Colombia, with an emphasis on RSV and hMPV. The samples studied here were obtained over a 12-year period and represent all age groups and both genders.(AU)eng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.issn1680-5348
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/2777
dc.language.isoeng
dc.publisherOrganización Panamericana de la Saludspa
dc.publisher.journalRevista Panamericana de Salud Publicaspa
dc.relation.ispartofseriesRevista Panamericana de Salud Pública, 1680-5348, Vol. 36, Nro. 2, 2014, p. 101-109spa
dc.relation.urihttps://iris.paho.org/xmlui/handle/123456789/9980
dc.rights.creativecommons2014
dc.rights.localAcceso cerradospa
dc.subjectVirus sincitiales respiratoriosspa
dc.subjectMetapneumovirusspa
dc.subjectreacción en cadena de la polimerasaspa
dc.subject.decsInfecciones del sistema respiratoriospa
dc.subject.decsTécnicas de diagnóstico del sistema respiratoriospa
dc.subject.decsBiología molecularspa
dc.subject.keywordsRespiratory syncytial virusesspa
dc.subject.keywordsmetapneumovirusspa
dc.subject.keywordsPolymerase chain reactionspa
dc.titleHuman respiratory syncytial virus and metapneumovirus in patients with acute respiratory infection in Colombia, 2000–2011spa
dc.typearticlespa
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.localartículospa

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