Análisis de redes de coexpresión identifica posibles genes clave en el envejecimiento de la corteza prefrontal humana

Vista sencilla de ítem
dc.contributor.authorRodríguez-Martínez, Carlos E.
dc.contributor.authorSossa-Briceño, Mónica P.
dc.contributor.authorPayan-Gomez, Cesar
dc.contributor.authorRiaño-Moreno, Julián
dc.contributor.authorAmador-Munoz, Diana Patricia
dc.contributor.authorRamírez-Clavijo, Sandra
dc.date.accessioned2020-03-07T13:34:01Z
dc.date.available2020-03-07T13:34:01Z
dc.date.issued2019
dc.description.abstractIntroducción: el envejecimiento es el principal factor de riesgo para el desarrollo de enfermedades crónicas como el cáncer, la diabetes, el Parkinson y el Alzheimer. El sistema nervioso central es particularmente susceptible al deterioro funcional progresivo asociado con la edad, entre las regiones cerebrales con mayor compromiso se encuentra la corteza prefrontal (cpf). Estudios de transcriptómica de esta región han identificado como características fundamentales del proceso de envejecimiento la disminución de la función sináptica y la activación de las células de la neuroglia. No es claro cuáles son las causas iniciales, ni los mecanismos moleculares subyacentes a estas alteraciones. El objetivo de este estudio fue identificar genes clave en la desregulación transcriptómica en el envejecimiento de la cpf para avanzar en el conocimiento de este proceso. Materiales y métodos: se hizo un análisis de coexpresión de genes de los transcriptomas de 45 personas entre 60 y 80 años con el de 38 personas entre 20 y 40 años. Las redes fueron visualizadas y analizadas usando Cytoscape, se usó citoHubba para determinar qué genes tenían las mejores características topológicas en las redes de coexpresión. Resultados: se identificaron cinco genes con características topológicas altas. Cuatro de ellos —hpca, cacng3, ca10, plppr4— reprimidos y uno sobreexpresado —cryab—. Conclusión: los cuatro genes reprimidos se expresan preferencialmente en neuronas y regulan la función sináptica y la plasticidad neuronal, mientras el gen sobreexpresado es típico de células de la glía y se expresa como respuesta a daño neuronal facilitando la mielinización y la regeneración neuronal.spa
dc.description.abstractenglishIntroduction: Aging is the main risk factor for the development of chronic diseases such as cancer, diabetes, Parkinson’s disease, and Alzheimer’s disease. The central nervous system is particularly susceptible to progressive functional deterioration associated with age, among the brain regions the prefrontal cortex (PFC) has one of the highest involvements. Transcriptomics studies of this brain region have identified the decrease in synaptic function and activation of neuroglia cells as fundamental characteristics of the aging process. The aim of this study was to identify hub genes in the transcriptomic deregulation in the PFC aging to advance in the knowledge of this process. Materials and methods: A gene co-expression analysis was carried out for 45 people 60 to 80 years old compared with 38 people 20 to 40 years old. The networks were visualized and analyzed using Cytoscape; citoHubba was used to determine which genes had the best topological characteristics in the co-expression networks. Results: Five genes with high topological characteristics were identified. Four of them —HPCA, CACNG3, CA10, PLPPR4— were repressed and one was over-expressed —CRYAB—. Conclusion: The four repressed genes are expressed preferentially in neurons and regulate the synaptic function and the neuronal plasticity, while the overexpressed gene is typical of glial cells and is expressed as a response to neuronal damage, facilitating myelination and neuronal regeneration.eng
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.doihttps://dx.doi.org/10.12804/revistas.urosario.edu.co/revsalud/a.7924
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.issn1692-7273
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/2003
dc.language.isoeng
dc.publisherUniversidad del Rosario, escuela de ciencias de la saludspa
dc.publisher.journalRevista Ciencias de la Saludspa
dc.relation.ispartofseriesRevista Ciencias de la Salud, 1692-7273, Vol. 17, Nro. 2, 2019, p. 201-22spa
dc.relation.urihttps://pure.urosario.edu.co/en/publications/co-expression-network-analysis-identifies-possible-hub-genes-in-a
dc.rightsAttribution-NonCommercial 4.0 International*
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf298
dc.rights.creativecommons2019
dc.rights.localAcceso abiertospa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/*
dc.subjectEnvejecimientospa
dc.subjectCorteza prefrontaspa
dc.subjectTranscriptómicaspa
dc.subject.decsEnfermedad crónicaspa
dc.subject.decsNeuroglíaspa
dc.subject.decsGenes reguladoresspa
dc.subject.keywordsAgingspa
dc.subject.keywordsPrefrontal cortexspa
dc.subject.keywordsTranscriptomicsspa
dc.titleAnálisis de redes de coexpresión identifica posibles genes clave en el envejecimiento de la corteza prefrontal humanaspa
dc.title.translatedCo-expression network analysis identifies possible hub genes in aging of the human prefrontal cortex
dc.typearticlespa
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.localartículospa

Archivos

Bloque original
Mostrando 1 - 1 de 1
Miniatura
Nombre:
César Payán-Gómez_2019.pdf
Tamaño:
564.32 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descripción:
Descargar
Bloque de licencias
Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
license.txt
Tamaño:
1.71 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descripción:
Descargar

Colecciones

Artículos