Caracterización y análisis bioinformático de regiones promotoras de Mycobacterium tuberculosis
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2013
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Resumen
Este trabajo realizó la caracterización y el análisis bioinformático de las regiones promotoras en el agente causal de la tuberculosis en humanos, Mycobacterium tuberculosis. El éxito de M. tuberculosis como patógeno recae en su habilidad de adaptarse a distintas condiciones dentro del hospedero. Estas adaptaciones dependen en la coordinación de la expresión génica a través de la regulación de la transcripción. Para entender mejor los promotores micobacterianos, se realizaron análisis estadísticos de la frecuencia de octámeros de DNA presentes en regiones promotoras de genes individuales y genes organizados en operones de las trece cepas de M. tuberculosis. Este tipo de análisis se basa en dos hechos, el primero tiene relación con el promedio de nucleótidos presentes por giro de DNA en el surco mayor es ocho nucleótidos y el segundo hecho con que las palabras, o motivos en el DNA de los organismos no siguen un patrón al azar, por el contrario, son conservadas debido a que el proceso evolutivo conserva las partes funcionales y las reutiliza para generar nuevas funciones. El conocer los sitios unión a factores de transcripción en M. tuberculosis puede ayudar a mejorar los métodos para combatir la tuberculosis a través del desarrollo de drogas diseñada para inhibir la expresión de determinados genes clave como son los genes factores de virulencia y variabilidad antigénica.
Descripción
Abstract
This study made a bioinformatics characterization and analysis of promoter regions in the responsible agent of tuberculosis in the human beings Mycobacterium tuberculosis. The succeed of M. tuberculosis as a pathogen is due to its skills to adapt in different conditions within hospedge. These adaptations depend on the coordination in the genetic expression through regulation in the transcriptional regulation. To understand better mycobacterial promoters, statistical analyses were performed in the octamer frequency of DNA that appears in promoters regions of individual gene and organized operons genes by thirteen strains of M. tuberculosis. This type of analysis is based on two facts; the first one has relation with the average of nucleotides that appear in DNA per spin in the main groove that is eight nucleotides and the second fact is that with words or patterns in the DNA of organisms do not follow a random pattern, On the contrary, they are conserved because of the evolutionary process maintains the functional parts and reuse it, to generate new functions. Knowing the binding transcriptional factors in M. tuberculosis could help to improve the methods for fighting the tuberculosis through the development of drugs designed to inhibit the expression of certain key genes such as virulence genes and antigenic variability.
Palabras clave
Promotores, Bioinformática, Mycobacterium tuberculosis, Frecuencia
Keywords
Promoters, Bioinformatics, Mycobacterium tuberculosis, Frequency