Borroni, DavideBonzano, ChiaraSánchez González, José MaríaRachwani Anil, RahulZamorano Martín, FranciscoPereza Nieves, JorgeTraverso, Carlo EnricoGarcía Lorente, MaríaRodríguez Calvo de Mora, MarinaEsposito, AlfonsoGodin, FernandoRocha de Lossada, Carlos2023-02-172023-02-1720231724-6016https://hdl.handle.net/20.500.12495/9981Propósito: Evaluar la microbiota de las muestras de queratitis microbiana de la membrana de impresión corneal (MIC) con cultivo negativo mediante el uso del análisis metagenómico de escopeta. Métodos: El ADN de las muestras de queratitis microbiana se recogió con CIM y se extrajo utilizando el MasterPure™ Complete DNA and RNA Purification Kit (Epicentre). El ADN se fragmentó por sonicación en fragmentos de 300 a 400 pares de bases (pb) utilizando Bioruptor® (Diagenode, Bélgica) y luego se utilizó como plantilla para la preparación de bibliotecas. Las bibliotecas de ADN se secuenciaron en Illumina® HiSeq2500. Las lecturas resultantes se sometieron a control de calidad, se recortaron y se compararon con el genoma humano de referencia. Las lecturas no mapeadas se clasificaron taxonómicamente utilizando el software Kraken. Resultados: Se incluyeron en el estudio 18 muestras de queratitis microbiana. En 5 muestras se encontró Brevundimonas diminuta, mientras que en 6 se observó la presencia de infecciones víricas. También se identificaron Cutibacterium acnes, Staphylococcus aureus, Moraxella lacunata y Pseudomonas alcaligenes como presunta causa putativa de la infección en 7 muestras. Conclusiones: La secuenciación Shotgun puede utilizarse como herramienta diagnóstica en muestras de queratitis microbiana. Este método de diagnóstico amplía las pruebas disponibles para diagnosticar infecciones oculares y podría ser clínicamente significativo en muestras con cultivo negativo.application/pdfengAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 InternacionalMetagenómicaQueratitisBrevundimonas diminutaCultivo negativoArtículo de revistaMetagenomicsKeratitisBrevundimonas diminutaCulture negativehttps://doi.org/10.1177/11206721221149077instname:Universidad El Bosquereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquerepourl:https://repositorio.unbosque.edu.cohttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessAcceso abierto