Visualización interactiva de defectos congénitos en menores de un año en Bogotá (2016-2019). Aplicación R/Shiny
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Resumen
Introducción: Los defectos congénitos, definidos como condiciones originadas durante el desarrollo embrionario o fetal pueden tener consecuencias de por vida, son objeto de detección y monitoreo de manera sistemática y oportuna con el fin de analizar su comportamiento epidemiológico, conlleva el procesamiento de grandes volúmenes de datos, y representa un desafío significativo en términos de tiempo y eficiencia para la toma informada de decisiones clínicas y epidemiológicas.
Objetivo: Este estudio tuvo como propósito presentar el diseño, desarrollo y evaluación de DashDC-SJ (Dashboard Defectos Congénitos, Hospital de San José), una aplicación interactiva de visualización de datos destinada al Servicio de Genética Médica de la Sociedad de Cirugía de Bogotá, Hospital de San José, con el fin de facilitar el análisis epidemiológico, la identificación de patrones, la generación de alertas clínicas tempranas, y la toma de decisiones informadas en casos de defectos congénitos mayores en menores de un año.
Métodos: DashDC-SJ fue desarrollado utilizando el lenguaje de programación R, de código abierto, junto con el paquete Shiny, que permite la creación de aplicaciones web interactivas dentro del entorno R.
Resultados: La herramienta permitió la generación dinámica de gráficos y resúmenes estadísticos, así como la filtración de variables para visualizar información específica. Además, ofreció la posibilidad de agrupar resultados y comparar subgrupos de pacientes según algunas características, lo que optimizó el análisis exploratorio de los datos. Esta capacidad favoreció la identificación de patrones y la generación de alertas clínicas tempranas, apoyando así la toma de decisiones informadas.
Conclusiones: DashDC-SJ demostró ser una solución viable para la visualización interactiva de datos en el contexto de la vigilancia epidemiológica, permite identificar patrones, generar alertas tempranas y tomar decisiones informadas, destacándose por su enfoque de código abierto y uso gratuito, lo que facilita su adaptación a distintos entornos institucionales.
Descripción
Abstract
Introduction: Congenital defects, defined as conditions originating during embryonic or fetal development, can have lifelong consequences, are subject to detection and monitoring in a systematic and timely manner in order to analyze their epidemiological behavior, entails the processing of large volumes of data, represents a significant challenge in terms of time and efficiency for clinical and epidemiological decision-making.
Objective: The purpose of this study was to present the design, development and evaluation of DashDC-SJ (Dashboard Birth Defects, Hospital de San José), an interactive data visualization application for the Medical Genetics Service of the Society of Surgery of Bogotá, Hospital de San José, in order to facilitate the epidemiological analysis identification of patterns, the generation of early clinical alerts, and informed decision-making in cases of major congenital defects in children under one year of age.
Methods: DashDC-SJ was developed using the open-source R programming language along with the Shiny package, which allows the creation of interactive web applications within the R environment.
Results: The tool allowed the dynamic generation of graphs and statistical summaries, as well as the filtering of variables to visualize specific information. In addition, it offered the possibility of grouping results and comparing subgroups of patients according to some characteristics, which optimized the exploratory analysis of the data. This ability favored the identification of patterns and the generation of early clinical alerts, thus supporting informed decision-making.
Conclusions: DashDC-SJ proved to be a viable solution for interactive data visualization in the context of epidemiological surveillance, it allows identifying patterns, generating early warnings and making informed decisions, standing out for its open source approach and free use, which facilitates its adaptation to different institutional environments.
Palabras clave
Defecto congénito, Dashboard, Shiny