Caracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemia

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dc.contributor.advisorRincón, Sandra
dc.contributor.authorOlivares Manrique, Paula Camila
dc.date.accessioned2021-11-09T12:35:08Z
dc.date.available2021-11-09T12:35:08Z
dc.date.issued2020
dc.description.abstractStaphylococcus aureus es uno de los principales patógenos del ser humano, que causa un espectro de infecciones clínicas que involucran desde la piel y los tejidos blandos hasta infecciones más graves como la bacteriemia. En la actualidad infecciones severas por Staphylococcus aureus susceptible a meticilina (SASM) son de gran relevancia y han excedido las causadas por Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM). La cefazolina, cefalosporina de primera generación ha mostrado buenos resultados terapéuticos, menos efectos adversos y mejor costo efectividad en infecciones graves causadas por SASM, y es una alternativa terapéutica de los agentes de primera línea en estas infecciones, las penicilinas estafilocócicas. Sin embargo, un obstáculo en la terapia clínica con cefazolina es el efecto inóculo a cefazolina (EIC), fenotipo definido como un aumento significativo en la CIM (concentración inhibitoria mínima) a cefazolina cuando el inóculo bacteriano se incrementa a 10 7 (UFC/ml) comparado con la CIM obtenida con el inóculo bacteriano estándar de 10 5 UFC/ml . El EIC se ha relacionado con falla terapéutica por cefazolina particularmente en enfermedades con alta carga bacteriana como la bacteriemia, endocarditis y también a mayor mortalidad. El presente estudio buscó caracterizar el genoma de aislamientos de S. aureus susceptibles a meticilina con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de bacteriemia a partir de un paciente. Se presenta la descripción de los hallazgos de la secuenciación de genoma completo para estudiar características genéticas asociadas al efecto inóculo a cefazolina y factores de virulencia. Asimismo, se discuten posibles hipótesis sobre el EIC como el tipo de betalactamasa, alotipo de BlaZ, y Agr, ya que el mecanismo genético de este fenotipo no se conoce completamente.spa
dc.description.abstractenglishStaphylococcus aureus is one of the main human pathogens causing a spectrum of clinical infections ranging from skin and soft tissue to more serious infections such as bacteremia. Currently, severe infections by methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA) are of great relevance and have exceeded those caused by methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). Cefazolin, a first-generation cephalosporin, has shown good therapeutic results, fewer adverse effects, and better cost effectiveness in severe infections caused by MSSA, and is a therapeutic alternative to first-line agents in these infections; staphylococcal penicillins. However, an obstacle in clinical therapy with cefazolin is the inoculum effect to cefazolin, a phenotype defined as a significant increase in the MIC (minimal inhibitory concentration) to cefazolin when the bacterial inoculum is increased to 10 7 (CFU/ml) compared to the MIC obtained with the standard bacterial inoculum of 10 5 (CFU / ml). The cefazolin inoculum effect (CIE) has been related to therapeutic failure due to cefazolin, particularly in diseases with high bacterial load such as bacteremia, endocarditis and also to higher mortality. The present study sought to characterize the genome of methicillin-susceptible S. aureus isolates with and without cefazolin inoculum effect recovered from bacteremia from a patient. A description of the findings of the whole genome sequencing is presented to study genetic characteristics associated with the inoculum effect of cefazolin and virulence factors. Likewise, possible hypotheses about CIE are discussed, such as the beta-lactamase type, BlaZ allotype, and Agr, since the genetic mechanism of this phenotype is not fully understood.eng
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameMédico cirujanospa
dc.description.sponsorshipMincienciasspa
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameinstname:Universidad El Bosquespa
dc.identifier.reponamereponame:Repositorio Institucional Universidad El Bosquespa
dc.identifier.repourlrepourl:https://repositorio.unbosque.edu.co
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12495/6335
dc.language.isospa
dc.publisher.facultyFacultad de Medicinaspa
dc.publisher.grantorUniversidad El Bosquespa
dc.publisher.programMedicinaspa
dc.rightsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional*
dc.rightsAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional*
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrightshttps://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.localAcceso abiertospa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/*
dc.subjectStaphylococcus aureus susceptible a meticilinaspa
dc.subjectBacteriemiaspa
dc.subjectFactores de virulenciaspa
dc.subjectBetalactamasasspa
dc.subjectAgrspa
dc.subjectEfecto inóculo a cefazolinaspa
dc.subject.decsStaphylococcus aureusspa
dc.subject.decsFactores de virulenciaspa
dc.subject.decsBeta-Lactamasasspa
dc.subject.keywordsCefazolin inoculum effectspa
dc.subject.keywordsMethicillin-susceptible Staphylococcus aureusspa
dc.subject.keywordsBacteremiaspa
dc.subject.keywordsVirulence factorsspa
dc.subject.keywordsAgrspa
dc.subject.keywordsBetalactamasesspa
dc.subject.nlmW100
dc.titleCaracterización genómica de aislamientos clínicos de Staphylococcus aureus susceptibles a meticilina, con y sin efecto inóculo a cefazolina recuperados de un paciente con bacteriemiaspa
dc.title.translatedGenomic characterization of clinical isolates of methycilin susceptible Staphylococcus aureus, with and without cefazoline inoculum effect recovered from a patient with bacteremiaspa
dc.type.coarhttps://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversionhttps://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.localTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradospa

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