Distribución geográfica del riesgo de presencia de influenza aviar en aves domésticas en Colombia
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Resumen
Objetivo. Establecer una distribución geográfica del riesgo de presencia de influenza aviar en aves domésticas utilizando como base las condiciones climáticas y los registros de presencia de los virus obtenidos entre los años 2022 y 2023. Materiales y métodos. Estudio observacional realizado a partir de los registros de presencia de en aves domésticas del virus de Influenza Aviar H5N1 detectados en Colombia durante los años 2022 y 2023. Dado que la viabilidad del virus de Influenza Aviar en el ambiente está influenciada por múltiples factores, entre los cuales se encuentran variables climáticas, se utilizaron modelos de nicho ecológico para predecir la distribución de áreas con características favorables para la infección en aves domésticas. Se crearon tres modelos utilizando algoritmos diferentes (Modelo lineal generalizado GML, modelo aditivo generalizado GAM y random forest), usando 6 de 21 variables climáticas evaluadas. El análisis de datos se realizó utilizando el software R versión 4.3.2. Resultados. Una vez evaluado el resultado, el análisis de curva ROC (AUC= 0,747) indica que el modelo utilizado tiene un buen desempeño, lo que sugiere una aproximación adecuada a las áreas potenciales y con aptitud para la presentación y el mantenimiento o supervivencia del virus en el ambiente, facilitando la infección en aves domésticas. Las zonas de la costa atlántica, así como la costa pacífica del sur del país muestran ser las de mayor potencial dentro del modelo, sin embargo, las zonas centro y nororientales del país presenta un potencial medio a considerar. Conclusiones. Los resultados obtenidos aportan información valiosa para la orientación de la vigilancia activa en aves domésticas y silvestres, permitiendo mejorar la sensibilidad de los sistemas de detección temprana. Si bien existen limitaciones dadas por la disponibilidad de los datos requeridos, las características y complejidades en el diseño de los algoritmos utilizados, y los resultados obtenidos en el abordaje de este tipo de estudios, es necesario explorar y ampliar el uso de estas herramientas como apoyo y complemento del abordaje epidemiológico para la toma de decisiones.
Descripción
Abstract
Objective. To establish a geographic distribution of the risk of avian influenza in domestic poultry using as a basis the climatic conditions and the records of virus presence obtained between 2022 and 2023. Materials and methods. Observational study based on records of the presence of H5N1 Avian Influenza virus in domestic birds detected in Colombia during the years 2022 and 2023. Since the viability of the Avian Influenza virus in the environment is influenced by multiple factors, including climatic variables, ecological niche models were used to predict the distribution of areas with favorable characteristics for infection in domestic birds. Three models were created using different algorithms (GML generalized linear model, GAM generalized additive model and random forest), using 6 of 21 climatic variables evaluated. Data analysis was performed using R software version 4.3.2. Results. Once the results were evaluated, the ROC curve analysis (AUC= 0.747) indicates that the model used has a good performance, which suggests an adequate approximation to the potential areas with aptitude for the presentation and maintenance or survival of the virus in the environment, facilitating the infection in domestic birds. The areas of the Atlantic coast, as well as the Pacific coast in the south of the country show the highest potential within the model; however, the central and northeastern areas of the country show a medium potential to be considered. Conclusions. The results obtained provide valuable information for the orientation of active surveillance in domestic and wild birds, allowing to improve the sensitivity of early detection systems. Although there are limitations due to the availability of the required data, the characteristics and complexities in the design of the algorithms used, and the results obtained in the approach of this type of studies, it is necessary to explore and expand the use of these tools as a support and complement to the epidemiological approach for decision making.
Palabras clave
Influenza Aviar, Nicho Ecológico, Clima, Modelos