Cambios de la microbiota intestinal neonatal relacionados con el uso de antibiótico intraparto en Los Cobos Medical Center: informe preliminar
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Resumen
El microbiota intestinal corresponde a la comunidad de microorganismos simbióticos del tracto gastrointestinal que desde el nacimiento y hasta el final de la vida, tiene importantes funciones nutricionales, metabólicas e inmunitarias. Esta colonización microbiana en el recién nacido está influenciada por factores como la vía del parto, la lactancia materna y la exposición a medicamentos particularmente antibióticos entre otros. Al momento de esta revisión de la literatura, se encontraron pocos datos sobre la diversidad bacteriana intestinal en el recién nacido y el posible efecto del uso de antibióticos maternos intraparto en la colonización microbiana de recién nacidos en Colombia. El objetivo de este estudio fue describir la microbiota intestinal en el periodo neonatal y a los 30 días de edad, y evaluar cambios por la exposición a antibióticos intraparto. Se realizó un estudio en una cohorte de recién nacidos atendidos en una institución de Colombia. Se incluyeron muestras de meconio de 39 neonatos al momento del nacimiento y muestras de materia fecal a los 30 días de vida de 23 neonatos. Se realizó un análisis taxonómico mediante secuenciación del gen 16S rARN y análisis bioinformático en QIIME2 y STAMP. Los resultados mostraron una disminución significativa del filo Bacillota en neonatos expuestos a antibióticos intraparto, así como un aumento de Bacteroidota y Spirochaetota. Lo anterior sugiere una alteración en la colonización bacteriana temprana post exposición a antibióticos intraparto. Al comparar la microbiota de los recién nacidos dentro de las primeras 24 horas y a los 30 días de vida según la vía de parto, las muestras de materia fecal de los nacidos por cesárea mostraron menor diversidad bacteriana y predominio de taxones distintos a los observados en partos vaginales. Adicionalmente, al comparar las muestras de todos los pacientes al nacimiento y las muestras tomadas al mes de vida, se encontró una reducción de Lactobacillales y un aumento progresivo de Clostridiales y Bacteroidales, indicando cambios en la microbiota probablemente afectado por factores como la lactancia materna y factores ambientales. Estos hallazgos sugieren que la exposición a antibióticos intraparto tiene un impacto detectable sobre el microbiota intestinal neonatal, en especial en la reducción de bacterias beneficiosas para la salud intestinal. Esta alteración temprana podría tener implicaciones en el desarrollo del sistema inmune y en la susceptibilidad a enfermedades futuras. Estos datos podrían ser uno de los primeros reportes de estudios de microbiota intestinal neonatal en una población colombiana que evalúa el efecto del uso de antibióticos intraparto. Estudios posteriores deben realizarse para continuar evaluando los factores que pueden afectar el microbiota intestinal neonatal.
Descripción
Abstract
The gut microbiota refers to the community of symbiotic microorganisms in the gastrointestinal tract, which from birth and throughout life, plays key nutritional, metabolic, and immune roles. In newborns, microbial colonization is influenced by several factors, including mode of delivery, breastfeeding, and exposure to medications—especially antibiotics. At the time of this literature review, limited data were available regarding the bacterial diversity of the intestinal microbiota in newborns and the potential effects of intrapartum maternal antibiotic use on microbial colonization in neonates in Colombia. The aim of this study was to describe the intestinal microbiota during the neonatal period and at 30 days of life, and to assess changes associated with intrapartum antibiotic exposure. We conducted a cohort study of newborns attended at a healthcare institution in Colombia. Meconium samples from 39 neonates at birth and stool samples from 23 infants at 30 days of life were collected. Taxonomic analysis was performed through 16S rRNA gene sequencing and bioinformatic processing using QIIME2 and STAMP. Results showed a significant decrease in the phylum Bacillota in neonates exposed to intrapartum antibiotics, along with an increase in Bacteroidota and Spirochaetota. These findings suggest that early microbial colonization may be disrupted by intrapartum antibiotic exposure. When comparing the microbiota between neonates within the first 24 hours and 30 days of life, stratified by mode of delivery, fecal samples from cesarean-born infants exhibited lower bacterial diversity and a predominance of taxa different from those observed in vaginal deliveries. Additionally, comparing all samples at birth and at one month of age revealed a decrease in Lactobacillales and a progressive increase in Clostridiales and Bacteroidales, suggesting shifts in microbiota composition potentially influenced by breastfeeding and environmental factors. These findings indicate that intrapartum antibiotic exposure has a measurable impact on the neonatal gut microbiota, particularly in reducing bacteria beneficial for intestinal health. Such early alterations may have implications for immune system development and susceptibility to future diseases. This study may represent one of the first reports on neonatal intestinal microbiota in a Colombian population assessing the effects of intrapartum antibiotic use. Further research is needed to continue exploring the factors that can influence neonatal gut microbiota development.
Palabras clave
Microbiota, Antibiótico, Cesárea, Meconio, Recien nacido