Análisis del perfil mutacional somático en pacientes colombianos con cáncer de mama
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Resumen
El cáncer de mama es una de las patologías más importantes a nivel mundial por su alta incidencia y mortalidad, según el Observatorio Mundial de Cáncer (GLOBOCAN) hay 200.000 casos nuevos por año en población latinoamericana y representan más de 50.000 muertes anuales. Esta patología resulta de la acumulación de alteraciones genéticas, de las cuales entre un 5-10% son atribuibles a antecedentes familiares y el restante a alteraciones esporádicas. Uno de los mayores retos para los investigadores y clínicos es la heterogeneidad propia del cáncer de mama, el cual es considerado como un grupo diverso de patologías que muestran claras diferencias en su comportamiento biológico y clínico. El objetivo de esta investigación es relacionar el perfil mutacional de pacientes colombianos con datos clínicos y epidemiológicos, comparar las variantes somáticas encontradas en la población en estudio (n=37) con las reportadas en las bases de datos mundiales y caracterizar el perfil mutacional de muestras de cáncer de mama con el propósito de conocer el paisaje mutacional local. Adicionalmente, conocer las firmas mutacionales en cáncer de mama de nuestra población. Las muestras obtenidas de tejido normal y/o buffy coat y tejido tumoral, fueron pareadas para la obtención de variantes somáticas. En la población en estudio se encontró que las variantes más frecuentes fueron halladas en los genes PIK3CA (50%) y TP53 (12.5%), lo que se correlaciona con los estudios realizados en otras poblaciones como la sueca, asiática, turca, árabe, egipcia e hispana. Asimismo, se obtuvieron los resultados de las firmas mutacionales, donde la firma COSMIC 24 fue encontrada en toda la población en estudio, lo cual no había sido descrito con anterioridad en una proporción tan alta, así como la firma COSMIC 6 y 15, estas dos últimas específicamente en pacientes con variantes en PIK3CA y TP53. El conocimiento del paisaje mutacional del cáncer de mama somático en Colombia podrá permitir al médico tratante valorar opciones de tratamiento y manejo del paciente. La terapia dirigida para variantes genéticas en algunos genes y el conocimiento de la resistencia a fármacos dependiendo del perfil mutacional encontrado ya es un hecho de la medicina de precisión, e implementar el análisis de variantes de forma rutinaria en muestras de cáncer de mama beneficiaría tanto al paciente, en cuanto a la progresión de la enfermedad como al sistema de salud nacional por el costo involucrado en la atención de los mismos. Por otro lado, con el conocimiento de las firmas mutacionales se pueden evaluar factores de riesgo relacionados con el desarrollo de la patología.
Descripción
Abstract
Breast cancer is one of the most important pathologies worldwide due to its high incidence and mortality rate. According to the World Cancer Observatory (GLOBOCAN), there are approximately 200,000 new cases per year among Latin Americans and more than 50,000 annual deaths. This pathology results from the accumulation of genetic alterations, 5-10% of which are attributable to family history and the rest to sporadic alterations. One of the greatest challenges for researchers and clinicians is the heterogeneity of breast cancer, which is considered a diverse group of pathologies that show clear differences in their biological and clinical behavior. The aim of this research is to relate the mutational profile of Colombian patients with clinical and epidemiological data, to compare the somatic variants found in the study population (n=37) with those reported in worldwide databases, to characterize the mutational profile of breast cancer samples in order to understand the local mutational landscape. Additionally, the research attempts to understand the mutational signatures of breast cancer in our population. Samples obtained from normal tissue and/or buffy coat and tumor tissue were paired to obtain somatic variants. In the study population, the most frequent variants were found in the PIK3CA (50%) and TP53 (12.5%) genes, which correlates with studies performed in other populations such as Swedish, Asian, Turkish, Arab, Egyptian, Hispanic. Likewise, when the results of mutational signatures were obtained the COSMIC 24 signature was found in the entire study population, which had not been previously described in such a high proportion. We also discovered COSMIC 6 and 15 signatures in a high proportion, specifically in patients with variants in PIK3CA and TP53 genes. Knowledge of the mutational landscape of somatic breast cancer in Colombia may allow the treating physician to better assess treatment options and improve patient management. Targeted therapy for genetic variants in some genes and the knowledge of drug resistance depending on the mutational profile found is already a fact of precision medicine. Therefore, implementing variant analysis routinely in breast cancer samples would benefit both patients, in terms of disease progression, and the national health system by reducing the cost involved in their care. Moreover, with knowledge of mutational signatures, risk factors related to the development of the pathology can be evaluated.
Palabras clave
Cáncer de mama, Variantes somáticas, Medicina de precisión, Firmas mutacionales, Perfil mutacional