Análisis de conglomerados de variables cualitativas para la caracterización de especies

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2021

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Resumen

El presente trabajo permitió determinar la mejor medida de distancia para variables cualitativas para el agrupamiento de especies biológicas mediante agrupamiento Jerárquico Aglomerativo. El mejor método de agrupamiento Jerárquico seleccionado fue el método de Ward (Ward, 1963), que nos permite calcular la distancia entre grupos para producir dichas agrupaciones. Para realizar las agrupaciones fue necesario contar con las medidas de similaridad Sokal & Sneath, Rogers & Tanimoto, Ochiai y Jaccard las cuales se emplearon en este trabajo. Después de eso, se realizó una validación de los clusters encontrados, lo cual consistió en comparar las medidas de similaridad, empleando los índices de Dunn (Dunn, 1974) y Silhouette (Rousseeuw, 1987).

Descripción

Abstract

The present work allowed determine the best distance measure for qualitative variables for the grouping of the biological species by means of grouping hierarchical agglomerative. The best method of the grouping hierarchical agglomerative was the method of the Ward (Ward, 1963), this allows to calculate the distance between groups to produce that groupings. To do this groupings was necessary count on the measures of similarity Sokal & Sneath, Rogers & Tanimoto, ochiai y Jaccard whose used this work. After that, it has been made a validation of the clusters found, this consist in compare the measures of similarity, use the indices of Dunn (Dunn, 1974) and Silhouette (Rousseeuw, 1987).

Palabras clave

Cluster Jerárquico, Ward, Medidas de similaridad, Validación de cluster, Índice de Dunn, Índice de Silhouette

Keywords

Hierarchical Cluster, Ward, Similarities measures, Cluster validation, Dunn index, Silhouette index

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