Diseño racional de un nuevo análogo inhibidor de la Metil-coenzima reductasa (MCR) con mejores propiedades farmacológicas, mediante cribado virtual basado en estructura y basado en ligando como alternativa para la reducción de metano entérico
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2025-05
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Resumen
La problemática de los gases de efecto invernadero ha sido una situación de gran atención a nivel mundial, ya que se han intentado tomar medidas para mitigar la producción de estos gases, evitando que la atmósfera se caliente debido a que estos gases aíslan el calor y posteriormente se aumente el calentamiento global. A medida que aumenta el calentamiento global se perturba el equilibrio de los ecosistemas y fenómenos climáticos extremos. Entre los gases más contaminantes están el óxido nitroso, el dióxido de carbono y el metano, donde este último ha sido el mayor contaminante desde los inicios de la industria agrícola. Se han utilizado varias estrategias para reducir la producción de este gas, pero no han sido eficaces, por lo que en este proyecto se diseñaron 5 moléculas promisorias en total, donde estas lograron obtener mejores propiedades farmacodinámicas y farmacocinéticas, también estas demostraron muy buena actividad inhibitoria de la metanogénesis. En total se logró llegar al diseño de 5 moléculas utilizando las estrategias de diseño racional basado en estructura y basado en ligando. Se genero un modelo optimo con un R^2 de 1.293 el cual fue bastante alto, pero fue validado indicando que su habilidad predictiva aceptable para predecir la inhibición de la metanogénesis en términos de porcentaje para los candidatos diseñados de manera in sílico. Los candidatos más promisorios fueron los siguientes: A4M1 (99,54 %), A3M4 (99,68 %), A1M10 (99,78 %) y A4M5 (99,49 %) obtuvieron porcentajes de inhibición de la metanogénesis
Descripción
Abstract
The problem of greenhouse gases has been a situation of great attention worldwide, since there have been attempts to take measures to mitigate the production of these gases, preventing the atmosphere from warming due to the fact that these gases insulate heat and subsequently increase global warming. As global warming increases, the balance of ecosystems and extreme climatic phenomena is disturbed. Among the most polluting gases are nitrous oxide, carbon dioxide and methane, where the latter has been the major pollutant since the beginning of the agricultural industry. Several strategies have been used to reduce the production of this gas, but they have not been effective, so in this project 5 promising molecules were designed in total, where these managed to obtain better pharmacodynamic and pharmacokinetic properties, also these showed very good inhibitory activity of methanogenesis. A total of 5 molecules were designed using the rational structure-based and ligand-based design strategies. An optimal model with an R^2 of 1.293 was generated which was quite high, but was validated indicating its acceptable predictive ability to predict methanogenesis inhibition in percentage terms for the in silico designed candidates. The most promising candidates were as follows: A4M1 (99.54 %), A3M4 (99.68 %), A1M10 (99.78 %) and A4M5 (99.49 %) obtained.
Palabras clave
Metanogénesis, MCR, Red neuronal, Inhibición de la metanogénesis
Keywords
Methanogenesis, MCR, Red neuronal, Inhibition of methanogenesis