Este ítem es privado
Correlación molecular por tipificación de secuencias multilocus (MLST) de aislamientos clínicos y ambientales de Cryptococcus neoformans / Cryptococcus gattii en seis departamentos de Colombia
Cargando...
Fecha
Autores
Título de la revista
Publicado en
Publicado por
URL de la fuente
ISSN de la revista
Título del volumen
Resumen
La incidencia anual promedio de la criptococosis en Colombia es de 2,4 casos x106 habitantes, en pacientes con SIDA es de 3,3 casos x103; los serotipos A y B son los más prevalentes; se ha reportado la presencia del hongo en el ambiente identificando los serotipos A, B y C en diferentes regiones del país. Como la criptococosis es adquirida presuntivamente por la inhalación de propágulos fúngicos presentes en el ambiente, es de gran importancia el estudio epidemiológico de esta enfermedad. Se tipificaron un total de 1063 aislamientos clínicos y ambientales mediante PCR huella digital y Polimorfismo de Longitud de Fragmento de Restricción, se identificaron cinco patrones moleculares entre el periodo 2005-2014, el patrón molecular VNI fue el más prevalente en aislamientos clínicos y ambientales; se genotipifico por MLST 110 aislamientos clínicos (n=61) y ambientales (n=49) se identificaron 21 secuencias tipos (ST), para C. neoformans se identificaron 13 ST entre las cepas de VNI y un ST para VNII; para C. gattii se identificaron tres ST para VGII y dos ST para VGI-VGIII respectivamente. Se realizaron tres mapas de predicción de nicho ecológico: dos de C. neoformans y uno de C. gattii, para la creación del modelo se emplearon casos humanos y lugares positivos de muestreos ambientales, combinando capas de datos ambientales influyentes para la presencia del hongo. Este estudio permitió conocer la distribución geográfica de los diferentes serotipos y patrones moleculares, se amplió el conocimiento acerca de la epidemiología, ecología y etiología de este patógeno en Colombia. Se demostró la importancia de combinar datos de casos clínicos, ambientales y datos moleculares para el estudio de la criptococosis, este enfoque fue esencial para identificar las asociaciones entre tipos de cepas.
Descripción
Abstract
The average annual incidence of cryptococcosis in Colombia is 2.4 X 106 inhabitants, in AIDS patients is 3.3 cases x103; serotypes A and B are the most prevalent; has reported the presence of the fungus in the environment by identifying the serotypes A, B and C in different regions. As cryptococcosis is presumptively acquired by inhaling fungal propagules present in the environment, it is very important epidemiological study of the disease. A total of 1063 clinical and environmental isolates were typed by PCR fingerprint and Fragment Length Polymorphism Restriction five molecular patterns between 2005-2014 were identified, the molecular pattern NIV was the most prevalent in clinical and environmental isolates; MLST was genotyped for 110 clinical isolates (n = 61) and environmental (n = 49) 21 sequence types (ST) were identified for C. neoformans 13 ST were identified among strains of NIV and ST for VNII; for C. gattii three ST for VgII and two ST for VGI-VGIII respectively they were identified. Three maps niche prediction were performed: two of C. neoformans and C. gattii one to model creation human cases and positive local environmental sampling, combining layers influential environmental data for the fungus were used. This study allowed to know the geographical distribution of the different serotypes and molecular patterns, knowledge about the epidemiology, ecology and etiology of this pathogen in Colombia expanded. the importance of combining data from clinical, environmental and molecular data for the study of cryptococcosis cases was demonstrated this approach was essential to identify associations between types of strains.
Palabras clave
Cryptococus gattii, Molecular, MLST, Correlación, Cryptococcus neoformans
Keywords
Correlation
Temáticas
Correlación de datos -- Cryptococcosis
Cryptococcosis -- Colombia
Anotación de secuencia molecular
Cryptococcosis -- Colombia
Anotación de secuencia molecular