Examinando por Autor "Planet, Paul J."
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Ítem A prospective cohort multicenter study of molecular epidemiology and phylogenomics of Staphylococcus aureus bacteremia in nine Latin American countries(American Society for Microbiology) Arias, Cesar A.; Reyes, Jinnethe; Carvajal Ortiz, Lina Paola; Rincon Núñez, Sandra; Diaz, Lorena; Panesso, Diana; Ibarra, Gabriel; Rios, Rafael; Munita, Jose M.; Alvarez-Moreno, Carlos; Labarca, Jaime; Garcia, Coralith; Luna, Carlos M.; Mejia-Villatoro, Carlos; Zurita, Jeannete; Guzman-Blanco, Manuel; Rodriguez-Noriega, Eduardo; Narechania, Apurva; Rojas, Laura J.; Planet, Paul J.; Weinstock, George M.; Gotuzzo, Eduardo; Seas, Carlos; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]; Carvajal Ortiz, Lina Paola [0000-0001-8301-8836]Ítem Antimicrobial sensing coupled with cell membrane remodeling mediates antibiotic resistance and virulence in enterococcus faecalis(National Academy of Sciences, 2020) Khan, Ayesha; Davlieva, Milya; Panesso, Diana; Rincon Núñez, Sandra; Millera, William R.; Diaz, Lorena; Reyes, Jinnethe; Cruz, Melissa R.; Pemberton, Orville; Nguyen, April H.; Siegel, Sara D.; Planet, Paul J.; Narechania, Apurva; Latorre, Mauricio; Rios, Rafael; Singh, Kavindra V.; Ton-That, Hung; Garsin, Danielle A.; Tran, Truc T.; Shamoo, Yousif; Arias, Cesar A; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]Ítem Dinámica de la población de SARM en un hospital chileno: un análisis filogenómico (2000-2016)(Genomics & Resistant Microbes (GeRM), ICIM, Facultad de Medicina Clínica Alemana, Universidad del Desarrollo, Santiago, Chile, 2023) Martínez, José R.W.; Planet, Paul J.; Spencer Sandino, Maria; Rivas, Lina; Díaz, Lorena; Moustafa, Ahmed M.; Quesille Villalobos, Ana; Riquelme Neira, Roberto; Alcalde Rico, Manuel; Hanson, Blake; Carvajal, Lina P.; Rincón, Sandra; Reyes, Jinnethe; Lam, Marusella; Calderón, Juan F.; Araos, Rafael; García, Patricia; Arias, César A.; Munita, José M.; Alcalde Rico, Manuel [0000-0002-1987-4600]; Rincón, Sandra [0000-0002-8482-4554]; Reyes, Jinnethe [0000-0002-1722-0734]La diseminación mundial de Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) está asociada a la aparición y el establecimiento de clones en zonas geográficas específicas. El clon chileno-cordobés (ChC) (ST5-SCCmecI) ha sido el clon de SARM predominante en Chile desde su primera descripción en 1998, a pesar del informe de otros clones de SARM emergentes en los últimos años. Aquí, caracterizamos la historia evolutiva de MRSA desde 2000 hasta 2016 en un centro de salud terciario chileno utilizando análisis filogenómicos. Secuenciamos 469 aislamientos de SARM recogidos entre 2000 y 2016. Evaluamos las tendencias temporales de los clones circulantes y realizamos una reconstrucción filogenómica para caracterizar la dinámica clonal. Encontramos un aumento significativo en la diversidad y riqueza de tipos de secuencia (STs; Spearman r = 0,8748, P , 0,0001) con un índice de diversidad de Shannon que aumentó de 0,221 en el año 2000 a 1,33 en 2016, y una diversidad efectiva (número de Hill; q = 2) que aumentó de 1,12 a 2,71. El análisis de la tendencia temporal reveló que en el periodo de 2000 a 2003 la mayoría de los aislados (94,2%; n = 98) pertenecían al clon ChC. Sin embargo, desde entonces, la frecuencia del clon ChC ha disminuido con el tiempo, representando el 52% de la colección en el período de 2013 a 2016. Este descenso estuvo acompañado por el aumento de dos linajes emergentes de SARM, ST105-SCCmecII y ST72-SCCmecVI. En conclusión, el clon ChC sigue siendo el linaje MRSA más frecuente, pero este linaje está siendo reemplazado gradualmente por varios clones emergentes, el más importante de los cuales es el clon ST105-SCCmecII. Hasta donde sabemos, éste es el mayor estudio de la dinámica clonal del SARM realizado en Sudamérica. © 2023 Martínez et al.Ítem Genomic epidemiology of vancomycin-resistant enterococcus faecium (VREfm) in Latin America: revisiting the global VRE population structure(Springer Nature, 2020) Rios, Rafael; Reyes, Jinnethe; Carvajal Ortiz, Lina Paola; Rincon Núñez, Sandra; panesso, diana; Dinh, An Q.; Kolokotronis, Sergios-Orestis; Narechania, Apurva; Tran, Truc T.; Munita, Jose M.; Murray, Barbara E; Planet, Paul J.; Arias, Cesar A.; Diaz, Lorena; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]; Carvajal Ortiz, Lina Paola [0000-0001-8301-8836]Ítem Global spread of the community-associated methicillin-resistant staphylococcus aureus USA300 latin american variant(Oxford University Press) Planet, Paul J.; Diaz, Lorena; Rios, Rafael; Arias, Cesar A.Ítem Methicillin-susceptible, vancomycin-resistant staphylococcus aureus, Brazil(Centers for Disease Control and Prevention, 2015) panesso, diana; Diaz, Lorena; Planet, Paul J.; Hugoneet, Jean-Emmanuel; Tran, Truc T.; Munita, Jose M.; Narechania, Apurva; Rincon Núñez, Sandra; Reyes, Jinnethe; Carvajal Ortiz, Lina Paola; Londoño, Alejandra; Smith, Hannah; Sebra, Robert; Deikus, Gintaras; Weinstock, George; Murray, Barbara; Rossi, Flavia; Arias, Cesar A; Arthur, Michel; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]; Carvajal Ortiz, Lina Paola [0000-0001-8301-8836]Ítem Parallel epidemics of community-associated methicillin-resistant staphylococcus aureus USA300 infection in north and south america(Oxford University Press, 2015) Planet, Paul J.; Diaz, Lorena; Kolokotronis, Sergios-Orestis; Narechania, Apurva; Reyes, Jinnethe; Xing, Galen; Rincon Núñez, Sandra; Smith, Hannah; Panesso, Diana; Ryan, Chanelle; Smith, Dylan P.; Guzman, Manuel; Zurita, Jeannete; Sebra, Robert; Deikus, Gintaras; Nolan, Rathel L.; Tenover, Fred C.; Weinstock, George M.; Robinson, D. Ashley; Arias, Cesar A.; Panesso, Diana [0000-0002-4049-9702]; Rincon Núñez, Sandra [0000-0002-8482-4554]Ítem Phylogenomic classification and the evolution of clonal complex 5 Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in the Western Hemisphere(Frontiers, 2018) Challagundla, Lavanya; Reyes, Jinnethe; Rafiqullah, Iftekhar; Sordelli, Daniel O.; Echaniz-Aviles, Gabriela; Velazquez-Meza, Maria E.; Castillo-Ramírez, Santiago; Fittipaldi, Nahuel; Feldgarden, Michael; Chapman, Sinéad B.; Calderwood, Michael S.; Carvajal Ortiz, Lina Paola; Rincón, Sandra; Hanson, Blake; Planet, Paul J.; Arias, César A.; Díaz, Lorena; Robinson, D. Ashley; Carvajal Ortiz, Lina Paola [0000-0001-8301-8836]Ítem Range expansion and the origin of USA300 North American Epidemic Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus(American Society for Microbiology, 2018) Challagundla, Lavanya; Luo, Xiao; Tickler, Isabella A.; Didelot, Xavier; Coleman, David C.; Shore, Anna C.; Coombs, Geoffrey W.; Sordelli, Daniel O.; Brown, Eric L.; Skov, Robert; Larsen, Anders Rhod; Reyes, Jinnethe; Robledo, Iraida E.; Vazquez, Guillermo J.; Rivera, Raul; Fey, Paul D.; Stevenson, Kurt; Wang, Shu-Hua; Kreiswirth, Barry N.; Mediavilla, Jose R.; Arias, César A.; Planet, Paul J.; Nolan, Rathel L.; Tenover, Fred C.; Goering, Richard V.; Robinson, D. Ashley