Examinando por Autor "Carvajal, Lina P."

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    A Test for the Rapid Detection of the Cefazolin Inoculum Effect in Methicillin-Susceptible Staphylococcus aureus
    (American Society for Microbiology, 2021) Rincon, Sandra; Carvajal, Lina P.; Gomez Villegas, Sara I.; Echeverri, Aura M.; Rios, Rafael; Dinh, An; Pedroza, Claudia; Ordoñez, Karen M.; Nannini, Esteban; Sun, Zhizeng; Fowler, Vance G.; Murray, Barbara E.; Miller, William R.; Palzkill, Timothy; Diaz, Lorena; Arias, Cesar A.; Reyes, Jinnethe; Palzkill, Timothy [0000-0002-5267-0001]; Reyes, Jinnethe [0000-0002-1722-0734]; Miller, William R. [0000-0002-1518-2973]
    El efecto inóculo de la cefazolina (CzIE) se ha asociado a fracasos terapéuticos y mortalidad en infecciones invasivas por Staphylococcus aureus sensible a la meticilina (MSSA). Actualmente no se dispone de una prueba diagnóstica para detectar el CzIE. Desarrollamos una prueba colorimétrica CzIE rápida (∼3 h) para detectar la actividad estafilocócica-β-lactamasa (BlaZ) en sobrenadantes tras la inducción con ampicilina. La prueba se validó utilizando 689 aislados de MSSA del torrente sanguíneo recuperados de Latinoamérica y Estados Unidos. Se utilizó como patrón de referencia la determinación de la CMI de cefazolina con un inóculo elevado (107 UFC/ml) (punto de corte ≥16 μg/ml). Todos los aislados se sometieron a secuenciación del genoma. Un total de 257 (37,3%) de los aislados de MSSA presentaron la CzIE por el método del estándar de referencia. La sensibilidad y especificidad globales de la prueba colorimétrica fueron del 82,5% y el 88,9%, respectivamente. La sensibilidad en los aislados de MSSA que albergaban BlaZ de tipo A (la enzima más eficaz contra la cefazolina) fue del 92,7%, con una especificidad del 87,8%. El rendimiento de la prueba fue inferior frente a las enzimas de tipo B y C (sensibilidades del 53,3% y el 72,3%, respectivamente). Cuando el valor de referencia se fijó en ≥32 μg/ml, la sensibilidad para los aislados portadores de enzimas de tipo A fue del 98,2%. La especificidad fue del 100% para el MSSA carente de blaZ. El valor predictivo negativo global osciló entre el 81,4% y el 95,6% en los países latinoamericanos utilizando las tasas de prevalencia publicadas de la CzIE. Los aislados de MSSA de los Estados Unidos eran genéticamente diversos, sin diferencias genómicas distintivas con respecto al MSSA latinoamericano, distribuidos entre 18 tipos de secuencia. Una nueva prueba puede identificar fácilmente la mayoría de los aislados de MSSA que presentan la CzIE, en particular los portadores del tipo A BlaZ. A diferencia de la determinación de la CMI utilizando un inóculo elevado, la prueba rápida es barata, factible y fácil de realizar. Tras unos pequeños pasos de validación, podría incorporarse al flujo de trabajo rutinario del laboratorio clínico.
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    Dinámica de la población de SARM en un hospital chileno: un análisis filogenómico (2000-2016)
    (Genomics & Resistant Microbes (GeRM), ICIM, Facultad de Medicina Clínica Alemana, Universidad del Desarrollo, Santiago, Chile, 2023) Martínez, José R.W.; Planet, Paul J.; Spencer Sandino, Maria; Rivas, Lina; Díaz, Lorena; Moustafa, Ahmed M.; Quesille Villalobos, Ana; Riquelme Neira, Roberto; Alcalde Rico, Manuel; Hanson, Blake; Carvajal, Lina P.; Rincón, Sandra; Reyes, Jinnethe; Lam, Marusella; Calderón, Juan F.; Araos, Rafael; García, Patricia; Arias, César A.; Munita, José M.; Alcalde Rico, Manuel [0000-0002-1987-4600]; Rincón, Sandra [0000-0002-8482-4554]; Reyes, Jinnethe [0000-0002-1722-0734]
    La diseminación mundial de Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) está asociada a la aparición y el establecimiento de clones en zonas geográficas específicas. El clon chileno-cordobés (ChC) (ST5-SCCmecI) ha sido el clon de SARM predominante en Chile desde su primera descripción en 1998, a pesar del informe de otros clones de SARM emergentes en los últimos años. Aquí, caracterizamos la historia evolutiva de MRSA desde 2000 hasta 2016 en un centro de salud terciario chileno utilizando análisis filogenómicos. Secuenciamos 469 aislamientos de SARM recogidos entre 2000 y 2016. Evaluamos las tendencias temporales de los clones circulantes y realizamos una reconstrucción filogenómica para caracterizar la dinámica clonal. Encontramos un aumento significativo en la diversidad y riqueza de tipos de secuencia (STs; Spearman r = 0,8748, P , 0,0001) con un índice de diversidad de Shannon que aumentó de 0,221 en el año 2000 a 1,33 en 2016, y una diversidad efectiva (número de Hill; q = 2) que aumentó de 1,12 a 2,71. El análisis de la tendencia temporal reveló que en el periodo de 2000 a 2003 la mayoría de los aislados (94,2%; n = 98) pertenecían al clon ChC. Sin embargo, desde entonces, la frecuencia del clon ChC ha disminuido con el tiempo, representando el 52% de la colección en el período de 2013 a 2016. Este descenso estuvo acompañado por el aumento de dos linajes emergentes de SARM, ST105-SCCmecII y ST72-SCCmecVI. En conclusión, el clon ChC sigue siendo el linaje MRSA más frecuente, pero este linaje está siendo reemplazado gradualmente por varios clones emergentes, el más importante de los cuales es el clon ST105-SCCmecII. Hasta donde sabemos, éste es el mayor estudio de la dinámica clonal del SARM realizado en Sudamérica. © 2023 Martínez et al.